Tofauti kuu kati ya PARP1 na PARP2 ni kwamba mmea na mnyama PARP1 hubeba motifu za kuunganisha DNA ya Zn-vidole huku mmea wa PARP2 ukibeba motifu za kumfunga DNA za N-terminal SAP.
Poly ADP ribose polymerase (PARP) ni familia ya protini ambazo ni vimeng'enya vya nyuklia. Kuna aina 17 tofauti za vimeng'enya vya PARP katika familia ya PARP. PARP1 na PARP2 ni vimeng'enya viwili muhimu kwa shughuli za kawaida za ukarabati wa DNA.
PARP ni nini?
PARP (Poly ADP ribose polymerase) ni familia ya protini ambazo hutumika katika michakato mingi ya seli kama vile kurekebisha DNA, uthabiti wa jeni na kifo kilichopangwa kwa seli. Wanachochea mchakato unaoitwa ADP-ribosylation. ADP-ribosylation inarejelea kuongezwa kwa vitengo vya ADP-ribose kutoka nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) ili kulenga substrates ili kurekebisha mipasuko ya DNA.
Enzymes za PARP ni protini zinazofunga DNA. Huwashwa na nick zilizopo kwenye molekuli za DNA. Pindi zinapofungamana kwa kukatika kwa DNA, wao hubadilisha hidrolisisi NAD+ kuwa nikotinamidi na kukuza upolimishaji wa ADP-ribose. Kwa hiyo, enzymes za nyuklia za PARP hushiriki katika ukarabati wa DNA. Zaidi ya hayo, poly-ADP-ribosylation hufanya kazi kama urekebishaji wa baada ya tafsiri ambao una jukumu muhimu katika urudufishaji, udhibiti wa unukuzi, udumishaji wa telomere na uharibifu wa protini. Vimeng'enya vya PARP pia hushiriki katika udumishaji wa uthabiti wa jenomu, udhibiti wa muundo wa kromatini, kuenea kwa seli, na apoptosis.
PARP1 ni nini?
PARP1 ni mwanachama wa familia ya protini ya PARP. Ni protini ya kwanza na yenye sifa bora zaidi katika familia hii. Inafanya kama jibu la kwanza ambalo hugundua uharibifu wa DNA na kisha kuwezesha uchaguzi wa utaratibu wa kurekebisha. Zaidi ya hayo, PARP1 hudhibiti urekebishaji wa uharibifu wa DNA ya mkondo mmoja.
Kielelezo 01: PARP1
Mbali na kurekebisha sehemu za kukatika kwa DNA ya ubeti mmoja, PARP1 hudhibiti urudiaji wa uma na kuwasha upya. Zaidi ya hayo, inakuza uunganisho mbadala usio na homologous.
PARP2 ni nini?
PARP2 ni protini nyingine mwanachama katika familia ya protini ya PARP. Inahusiana kwa karibu na kimeng'enya cha PARP1. Nambari za jeni PARP2 za protini ya PARP2 kwa wanadamu. PARP2 ina kikoa cha kichochezi lakini haina kikoa cha kuunganisha cha DNA cha N terminal. Dawa za kuzuia saratani za PARP zinaweza kuzuia PARP2, sawa na PARP1.
Kielelezo 02: PARP2
Kwenye mimea, hasa katika Arabidopsis thaliana, PARP2 ina jukumu kubwa katika majibu ya kinga kwa uharibifu wa DNA na pathogenesis ya bakteria kuliko PARP1.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya PARP1 na PARP2?
- PARP1 na PARP2 ni aina mbili za vimeng'enya vya nyuklia.
- Wanatumia NAD+ kama substrate yao ili kuchochea ribosylation ya ADP ya aina nyingi.
- Zote mbili huwashwa kwa mapumziko ya mkondo mmoja wa DNA.
- Mamalia PARP1 na PARP2 ziko kwenye kiini.
- PARP1 na PARP2 huingiliana na chromatin.
- Wanarekebisha uharibifu wa DNA.
- Baadhi ya dawa za kuzuia saratani za PARP zinazolenga PARP1 pia huzuia PARP2.
Nini Tofauti Kati ya PARP1 na PARP2?
PARP1 ni mwanachama wa familia ya protini ya PARP ambayo ina kikoa cha kichocheo na kikoa cha kuunganisha DNA ya N-terminal huku PARP2 ni mwanachama wa familia ya PARP ambayo haina kikoa cha kumfunga DNA ya N-terminal. Tofauti kuu kati ya PARP1 na PARP2 ni kwamba PARP1 ya mmea na mnyama hubeba motifu zinazofunga DNA ya Zn-finger ilhali mmea PARP2 hubeba motifu za kumfunga N-terminal SAP DNA.
Infographic ifuatayo ni muhtasari wa tofauti kati ya PARP1 na PARP2.
Muhtasari – PARP1 dhidi ya PARP2
PARPs ni vimeng'enya vya nyuklia vinavyohisi uharibifu wa DNA na kuvirekebisha. PARP1 na PARP2 ni mbili kati yao ambazo zina uhusiano wa karibu. Enzymes zote mbili zina kikoa cha kichocheo. Lakini PARP2 haina kikoa cha kumfunga DNA cha N-terminal ambacho kipo katika PARP1. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya PARP1 na PARP2. Aina zote mbili za vimeng'enya hutumia NAD+ kama substrate yao.
