Tofauti kuu kati ya CRISPR na CRISPR Cas9 ni kwamba CRISPR (iliyounganishwa mara kwa mara na kurudiwa kwa palindromic fupi) ni utaratibu wa asili wa ulinzi wa kinga ya prokaryotic wakati CRISPR cas9 ni nuclease ya Cas9 inayoongozwa na RNA ambayo ni sehemu ya adapta ya CRISPR. mfumo wa kinga.
CRISPR ni mfumo wa kinga dhidi ya virusi unaopatikana katika bakteria na archaea. Ni familia ya mfuatano wa DNA unaopatikana katika jenomu ya bakteria. Inajumuisha mfuatano wa spacer ambao unatokana na vipande vya DNA vya bacteriophages ambavyo vilikuwa vimewaambukiza hapo awali. Katika maambukizi ya virusi yanayofuata, bakteria hutumia mlolongo huu kuharibu DNA ya virusi. Mifuatano ya CRISPR ina marudio mafupi ya palindromic na mpangilio wa spacer. Zaidi ya hayo, mfuatano wa kurudia wa spacer wa CRISPR mara nyingi huwa na jeni zinazohusiana ambazo zinaonyesha protini za Cas. Cas9 ni endonuclease inayoongozwa na RNA. Pamoja na mfuatano wa CRISPR, protini ya Cas9 hufanya kazi kama mfumo wa kinga unaobadilika katika bakteria dhidi ya bacteriophages.
CRISPR ni nini?
CRISPR inawakilisha Marudio Mafupi ya Palindromic Yaliyounganishwa Mara kwa Mara. Ni kundi la mfuatano wa DNA unaopatikana katika jenomu ya bakteria. Inafanya kazi kama njia ya asili ya ulinzi katika bakteria, na ilitambuliwa kwa mara ya kwanza katika E. koli. Katika bakteria, hufanya kama ulinzi wa kinga ya kukabiliana, hasa dhidi ya bacteriophages. Kwa hivyo, ni utaratibu mahususi wa mfuatano.
Kielelezo 01: CRISPR
Mfumo wa CRISPR una mpangilio kadhaa wa marudio wa DNA wa sehemu fupi. Marudio haya ni palindromic, kuwa na mlolongo wa msingi sawa wakati wa kusoma kutoka 5' hadi 3' wakati nyingine inatoa mlolongo sawa wakati wa kusoma kutoka 3' hadi 5'. Kwa kuongeza, kurudia ni sawa. Ziko kati ya mfuatano mfupi wa DNA wa "spacer" ambao haufanani. Lakini mlolongo huu wa DNA wa spacer ni sawa au unalingana na DNA ya bacteriophage ya kigeni. Jeni zinazohusishwa na CRISPR zinajulikana kama jeni zinazohusiana na CRISPR au jeni za Cas. Msimbo wa jeni za Cas za protini za Cas ambazo ni helikasi au viini. Helikosi hupunguza DNA huku viini vinakata DNA. Kwa ujumla, ukizingatia CRISPR, ni mfumo wa kinga wa bakteria ambao hufanya kazi dhidi ya bacteriophages (bakteria wanaoambukiza virusi).
CRISPR Cas9 ni nini?
Cas9 au CRISPR inayohusishwa na protini 9 ni endonuclease inayoongozwa na bakteria ya RNA. Kwa hivyo, ni kimeng'enya kinachotambua na kukata DNA inayolengwa (hasa DNA ya bakteria) inayosaidiana na mwongozo wa RNA. Hubeba mpasuko maalum wa strand. Protini ya Cas9 imewekwa na jeni inayohusishwa na CRISPR. CRISPR cas9 ni mfumo wa viini vya CRISPR-Cas9 unaoongozwa na RNA ambao unaweza kutumika kama jukwaa la kulenga na kuhariri la DNA ya RNA kwa uhariri wa jenomu, usumbufu wa maandishi, urekebishaji epijenetiki, na upigaji picha wa jenomu. Mfumo huu wa CRISPR cas9 ni maarufu sana katika mifumo ya sasa ya uhariri ya jenomu.
Kielelezo 02: CRISPR Cas9
Kwa sasa, mfumo wa CRISPR/Cas9 unatumika kubadilisha au kurekebisha jenomu ya mamalia kwa ukandamizaji wa nukuu au kuwezesha. Seli za mamalia zinaweza kujibu mivunjiko ya DNA iliyopatanishwa ya CRISPR/Cas9 kwa kutumia utaratibu wa urekebishaji. Inaweza kufanywa kwa kutumia njia ya kujiunga na mwisho isiyo ya homologous (NHEJ) au ukarabati unaoelekezwa kwa homolojia (HDR). Mbinu hizi zote mbili za ukarabati hufanyika kwa kuanzisha mapumziko yenye nyuzi mbili. Hii inasababisha kuhariri jeni za mamalia. NHEJ inaweza kusababisha kukomesha mabadiliko ya jeni na inaweza kutumika kusababisha hasara ya athari za utendakazi. HDR inaweza kutumika kwa ajili ya kutambulisha mabadiliko maalum ya nukta au kuanzisha sehemu za DNA za urefu tofauti. Kwa sasa, mfumo wa CRISPR/Cas unatumika katika nyanja za matibabu, matibabu, kilimo na maombi ya utafiti.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya CRISPR na CRISPR Cas9?
- Cas9 ni sehemu ya mfumo wa CRISPR Cas.
- Mfumo wa Crisper cas9 ni mfumo wa kinga unaopatikana katika bakteria kiasili.
Nini Tofauti Kati ya CRISPR na CRISPR Cas9?
CRISPR ni kundi la mfuatano wa DNA unaopatikana katika jenomu ya bakteria ambayo hufanya kazi kama mfumo wa ulinzi wa asili dhidi ya bacteriophages. Inajumuisha marudio mafupi ya palindromic yaliyounganishwa mara kwa mara, spacers na jeni zinazohusiana. Kinyume chake, cas9 ni protini 9 inayohusishwa na CRISPR, ambayo ni kimeng'enya cha endonuclease kinachoongozwa na RNA. Inatambua na kugawanya nyuzi mbili za DNA za virusi. Kwa kweli, ni sehemu ya mfumo wa ulinzi wa CRISPR. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya CRISPR na CRISPR cas9.
Muhtasari – CRISPR dhidi ya CRISPR Cas9
CRISPR Cas mfumo ni mfumo wa ulinzi wa vijidudu. CRISPR ni kundi la mifuatano ya DNA inayojumuisha marudio mafupi ya palindromic, mfuatano wa spacer na jeni zinazohusiana. Cas9 ni protini ya Cas ambayo ni endonuclease inayoongozwa na RNA. Protini ya CRISPR na Cas9 hutengeneza mfumo wa kinga ambao hufanya kazi dhidi ya maambukizo ya bakteria kwenye bakteria. Protini ya Cas9 ina uwezo wa kupasua DNA ya virusi vya kigeni na kuzivuruga. CrRNA inaongoza cas9 kutambua DNA ya virusi. Kwa hiyo, mfumo wa CRISPR cas9 ni mfumo wa asili wa kinga unaopatikana katika bakteria dhidi ya virusi. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya CRISPR na CRISPR cas9.
