Tofauti kuu kati ya sinteni na collinearity ni kwamba sinteni ni ujanibishaji wa kimaumbile wa loci ya kijeni kwenye kromosomu sawa katika spishi, huku collinearity ni ujanibishaji mwenza wa loci ya kijeni kwenye kromosomu sawa katika spishi tofauti zinazohifadhi. agizo sawa.
Sintenia na collinearity ni istilahi mbili zinazotumika kwa kubadilishana katika jenomiki. Istilahi zote mbili zinaelezea mwelekeo wa ujanibishaji wa jeni kwenye kromosomu katika spishi tofauti. Mipangilio hii ya jeni inayohusiana kati ya taxa ni habari muhimu wakati wa kuashiria asili ya pamoja ya jeni. Synteny inarejelea ujanibishaji wa kimaumbile wa loci ya kijeni kwenye kromosomu sawa katika spishi. Collinearity inarejelea ujanibishaji wa kimaumbile wa loci ya kijeni kwenye kromosomu sawa katika spishi tofauti zinazohifadhi mpangilio sawa. Kwa hivyo, ni aina ya sinteni.
Synteny ni nini?
Katika spishi tofauti, kuna seti ya jeni inayopatikana kwenye kromosomu sawa. Na, ujanibishaji huu wa kimaumbile wa jeni kwenye kromosomu sawa katika spishi tofauti hujulikana kama sinteni. Pia, jeni hizi zinapatikana karibu sana kwa kila mmoja kwenye kromosomu moja. Mpangilio wa jeni hauwezi kuwa sawa. Lakini, ujanibishaji wa jeni karibu na kila mmoja kwenye kromosomu sawa hufanyika katika synteny. Kwa hivyo, sinteni huelezea hasa muundo wa usambazaji wa jeni kwenye kromosomu. Mifumo hii ya ujanibishaji wa jeni huonyesha uhusiano kati ya spishi tofauti na mageuzi yao. Hata hivyo, sinteni inaweza kukatizwa kutokana na upangaji upya wa kromosomu kama vile uhamishaji, ugeuzaji na muunganisho wa kromosomu, n.k. urudufu, upotevu na upatanisho usio sawa wa homologous.
Kielelezo 01: Synteny
Inaaminika kuwa jeni zote zilizounganishwa ni za sintenishi. Walakini, sio jeni zote za syntenic zinazounganishwa. Wana mfuatano wa kawaida wa kromosomu. Wanadamu wana jeni nyingi za syntenic na mamalia wengine. Zaidi ya hayo, nafaka nyingi zina jeni za syntenic.
Collinearity ni nini?
Collinearity ni aina mahususi zaidi ya sintenishi ambapo seti ya jeni ziko kwenye kromosomu sawa ya spishi tofauti kwa mpangilio sawa na katika spishi za mababu. Kwa hivyo, ikiwa kuna mkengeuko kutoka kwa collinearity, itakuwa tabia inayotegemeka zaidi ya kifilojenetiki kwani collinearity inaelezea asili ya pamoja ya jeni.
Kielelezo 02: Collinearity
Uchanganuzi wa Multiway collinearity hutoa maelezo ya kuaminika zaidi kuhusu spishi husika na filojeni zao.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Synteny na Collinearity?
- Katika ulinganifu na collinearity, seti ya loci katika spishi mbili tofauti iko kwenye kromosomu sawa.
- Masharti haya yanafafanua ujanibishaji wa kimaumbile wa loci ya kijeni kwenye kromosomu sawa.
- Collinearity ni aina mahususi zaidi ya sinteni.
- Wakati mwingine istilahi zote mbili hutumika kwa kubadilishana katika jenomiki.
- Iwapo maeneo mawili yana collinearity, ni wazi ni sawa.
- Zinafaa katika kukisia filojeni.
Nini Tofauti Kati ya Synteny na Collinearity?
Sintenia na collinearity ni istilahi mbili zinazotumika kwa kubadilishana katika jenomiki. Synteny inarejelea ujanibishaji mwenza wa seti ya jeni katika kromosomu sawa katika spishi tofauti. Collinearity ni aina ya synteny ambapo seti ya jeni huwekwa kwa pamoja kwa mpangilio sawa kati ya spishi tofauti. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya synteny na collinearity.
Muhtasari – Synteny vs Collinearity
Masharti synteny na collinearity hurejelea seti ya jeni ambazo ziko kwenye kromosomu sawa katika spishi tofauti. Kwa kweli, jeni hizi zimeunganishwa katika kromosomu sawa katika spishi tofauti. Synteny inafafanua ujanibishaji mwenza wa jeni zilizowekwa kwenye kromosomu sawa katika spishi tofauti, huku collinearity ni aina mahususi zaidi ya usanisi ambapo seti ya jeni hujanibishwa kwa mpangilio sawa. Kwa hivyo, hii inatoa muhtasari wa tofauti kati ya sinteni na collinearity.