Tofauti kuu kati ya QTL na GWAS inategemea aina ya mfuatano unaotumika katika uchanganuzi. QTL hutumia loci ya jeni ya kiunganishi kuchanganua sifa za phenotypic zinazohusishwa na urithi wa polijeni huku GWAS inatumia mfuatano mzima wa jenomu kuchanganua upolimishaji mmoja wa nyukleotidi wa hali fulani.
Ramani za QTL na GWAS zina jukumu muhimu katika uchanganuzi wa vinasaba kwa sifa tofauti. Zaidi ya hayo, ni muhimu katika kuchambua hali mbalimbali za ugonjwa na etiolojia isiyojulikana. Kwa kuongeza, mpangilio una jukumu muhimu katika mbinu zote mbili. Mbinu hizi zinaweza kuunganishwa zaidi na mbinu zingine za upitishaji wa hali ya juu ili kuongeza usahihi na usahihi.
QTL ni nini?
QTL inawakilisha Quantitative Trait Locus. Ni eneo la DNA linalohusishwa na sifa ya phenotypic. Kwa ujumla, QTL hutoa athari za polijeni. Usambazaji wa QTL hutofautiana, na idadi ya QTL inapendekeza kiwango cha utofauti wa sifa fulani ya phenotypic. Zaidi ya hayo, kwa kawaida wao huweka misimbo kwa ajili ya sifa bainifu zinazoendelea na si sifa bainifu.
Baada ya utambulisho wa maeneo ya QTL, ni muhimu kupanga eneo fulani la QTL. Zaidi ya hayo, ili kurahisisha uchunguzi na utafiti, kupanga na kuhifadhi data ya mfuatano wa maeneo ya kawaida ya QTL hufanyika kwa kuhusika kwa bioinformatics. Mbinu hii tunaiita QTL ramani. Baadaye, hifadhidata inaundwa na mpangilio wa eneo la QTL.
Kielelezo 01: QTL Scan
Zaidi ya hayo, utumizi wa mpangilio wa QTL hutegemea zaidi zana ya BLAST, ambapo mfanano wa mfuatano unaweza kubainishwa. Ni muhimu katika kuamua uhusiano kati ya viumbe. Zaidi ya hayo, ni muhimu katika kuamua utata wa phenotype fulani ya polygenic. Pia huamua mageuzi ya sifa fulani.
Kwa sasa, uchanganuzi wa QTL umeunganishwa na mbinu zingine za upitishaji wa juu kama vile safu ndogo za DNA. Hii ni muhimu katika uchanganuzi wa usemi wa phenotype. Kwa sasa, wanasayansi wanapenda sana kutengeneza hifadhidata ya QTL kwa kuwa maeneo ya QTL yanawajibika kwa sifa nyingi muhimu za spishi tofauti.
GWAS ni nini?
GWAS inasimamia Genome Wide Association Study. Pia inarejelea masomo ya muungano mzima wa jenomu. Masomo haya yanalenga zaidi masomo ya uchunguzi. Inachanganua vibadala vya kijenetiki vya watu tofauti kwa kawaida vinavyohusishwa na sifa maalum. Zaidi ya hayo, jenomu nzima ni muhimu kwa uchanganuzi wa GWAS.
Kielelezo 02: GWAS
GWAS ni zana muhimu katika uchanganuzi wa upolimishaji wa nyukleotidi moja inayohusishwa na hali mbalimbali za ugonjwa. Huu pia ni uchunguzi linganishi wa upolimishaji tofauti wa nyukleotidi moja katika idadi kubwa ya watu. Aidha, sampuli ya utafiti wa GWAS ni ya juu sana; kwa hivyo, inachukua pia umbizo la utafiti wa makundi mbalimbali.
Zaidi ya hayo, utafiti wa kwanza wa GWAS ulifanyika kuhusiana na infarction ya myocardial na kuchanganua jeni zinazohusiana na infarction ya myocardial. Kwa sasa, GWAS ina jukumu muhimu katika kubainisha usuli wa kinasaba wa magonjwa changamano na etiolojia isiyojulikana.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya QTL na GWAS?
- Wanategemea data ya mfuatano wa DNA kwa uchanganuzi.
- Zote mbili zinahusishwa na asili za kinasaba za wahusika mbalimbali.
- Zaidi ya hayo, zinahitaji zana za bioinformatics ili kugundua na kutafsiri matokeo.
- Zinafanywa kwa idadi kubwa ya watu.
Nini Tofauti Kati ya QTL na GWAS?
QTL huchanganua sifa za phenotypic zinazohusiana na urithi wa polijeni kwa kutumia loci ya jeni iliyounganishwa huku GWAS inachanganua polimamofimu za nyukleotidi za hali fulani kwa kutumia mfuatano mzima wa jenomu. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya QTL na GWAS. Uchoraji ramani wa QTL kwa kulinganisha ni mbinu changamano changamano kuliko GWAS kwani inahitaji mpangilio mzima wa jenomu.
Fografia iliyo hapa chini ni muhtasari wa tofauti kati ya QTL na GWAS katika umbo la jedwali.
Muhtasari – QTL dhidi ya GWAS
QTL ramani na GWAS ina jukumu kubwa katika kubainisha usuli wa kijeni wa sifa mbalimbali za phenotypic. Pia husaidia katika kuchambua asili ya maumbile ya magonjwa tofauti. Uchoraji ramani wa QTL hupanga jeni za uhusiano zinazowajibika kwa sifa zinazoendelea, na pia huhusisha kuchora jeni za urithi za aina nyingi. GWAS, kwa upande mwingine, hufanyika kwa kuchanganua jenomu nzima kwa upolimishaji wa nyukleotidi moja. Kwa kuongezea, hii hufanyika katika idadi kubwa ya watu. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya QTL na GWAS.
