Tofauti kuu kati ya kugonga jeni na kuangusha jeni ni kwamba kugonga jeni ni mbinu ambapo jeni la riba huondolewa kabisa (hali isiyofanya kazi) ili kusoma utendakazi wa jeni huku kuangusha jeni ni mbinu nyingine ambapo jeni la maslahi yamezimwa ili kuchunguza dhima ya jeni fulani katika mfumo wa kibiolojia.
Mbinu tofauti za kijeni zinaendelea kufanya kazi ili kuchunguza utendakazi wa jeni ndani ya mifumo hai ya kibiolojia. Gene knockout na knockdown ni mbili kama mbinu. Mbinu hizi husaidia wanasayansi kutambua vipengele vya utendaji vya jeni mbalimbali katika viumbe hai.
Jeni Knockout ni nini?
Kugonga kwa jeni ni mbinu ya kijeni inayofanya jeni moja au zaidi kutofanya kazi katika viumbe hai. Huu pia ni mchakato wa kuzima au kufuta jeni la kiumbe. Utumizi wa kimsingi wa mbinu hii ni kusoma kazi ya jeni. Mchakato hutathmini athari ya jeni iliyopotea au kuondolewa. Mchakato wa mtoano pia unahusisha vimeng'enya fulani na mbinu za kuunganisha.
Kielelezo 01: Jeni Knockout
Kuna tofauti chache katika mbinu ya kuondoa jeni kulingana na idadi ya jeni zinazohusika. Ni mtoano mara mbili (kugonga jeni mbili), mtondoo mara tatu (mgongano wa jeni tatu) na mtoano mara nne (mgongano wa jeni nne). Mtoano wa jeni umeainishwa zaidi katika makundi mawili; mikwaju ya heterozygous na mikwaju ya homozygous.
Jeni Knockdown ni nini?
Kuangusha jeni ni utaratibu wa majaribio ambapo utaratibu huu hukandamiza au kupunguza usemi wa jeni fulani au jeni za kiumbe fulani. Kunyamazisha jeni ni ufafanuzi wa kawaida wa kuangusha jeni. Wakati wa utaratibu huu, uanzishaji au uharibifu wa mRNA iliyozalishwa inahusisha kuingiliwa kwa RNA (RNAi), RNA ndogo inayoingilia (siRNA) na nywele fupi ya RNA (shRNA).
Kielelezo 02: Kunyamazisha Jeni
Matumizi ya kimsingi ya kuangusha jeni ni kuchunguza dhima ya jeni mahususi katika mfumo wa kibiolojia. Kwa hivyo, mbinu hii inakamilisha uchunguzi wa onkojeni (Bcl-2 na P53) na jeni zinazosababisha magonjwa ya mishipa ya fahamu, maambukizo ya virusi na magonjwa ya kurithi.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Gene Knockout na Knockdown?
- Zote mbili kugonga jeni na kuporomoka kwa jeni ni mbinu za kijeni.
- Mbinu hizi mbili zinaweza kuzuia usemi wa jeni.
- Matumizi ya kimsingi ya mbinu zote mbili ni kuchunguza utendakazi wa jeni la kuvutia.
- Wote wawili wana uwezo wa kubainisha hali tofauti za ugonjwa (kinasaba).
- Zote zinaweza kutumika kwa jeni moja au zaidi zinazokuvutia.
Kuna tofauti gani kati ya Gene Knockout na Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Mgongano wa jeni ni utendakazi wa jeni (kuondoa jeni kutoka kwa DNA) ya kiumbe kupitia mbinu tofauti za kijeni. | Kuangusha jeni ni utaratibu wa majaribio wa kukandamiza (kupunguza au kunyamazisha) usemi wa jeni fulani au jeni za kiumbe fulani. |
| Function | |
| Huwezesha uchunguzi wa utendaji kazi wa jeni kwa kuchanganua matokeo ya jeni iliyopotea. | Huwezesha utafiti wa onkojeni, jeni zinazosababisha magonjwa ya mishipa ya fahamu, maambukizo ya virusi na magonjwa ya kurithi. |
| Ushiriki wa Mawakala wa RNA | |
| Kuhusika kwa mawakala wa RNA sio muhimu katika mbinu hii. | Mchakato huo unahusisha mawakala kama vile siRNA, shRNA, na RNAi ili kuwezesha mRNA. |
| Matumizi ya Wakala wa Kemikali | |
| Ajenti za Enzymatic zinatumika. | Hakuna kemikali kama hizi zinazotumika. |
| Athari kwenye Jeni | |
| Huondoa kabisa jeni kutoka kwa DNA. | Zima au zima jeni. |
| Ainisho | |
| Mtoano mara mbili, mtoano mara tatu na mtoano mara nne na mtoano wa heterozygous na homozygous ni aina tofauti za mtoano wa jeni. | Hakuna mifumo kama hii ya uainishaji inayopatikana ya kunyamazisha jeni. |
Muhtasari – Gene Knockout vs Gene Knockdown
Mbinu mbili tulizojadili hapa; kugonga na kuangusha jeni, ni mbinu za kuchunguza kazi za jeni mbalimbali. Utoaji wa jeni hufanya kabisa jeni kutofanya kazi huku kuporomoka kwa jeni kunyamazisha jeni la kupendeza. Walakini, taratibu zote mbili huzuia usemi wa jeni. Wakala tofauti wana uwezo wa kukamilisha michakato hii miwili. Gene knock out ni aina ya ufutaji ilhali kuporomoka kwa jeni ni aina ya kuwezesha. Hii ndio tofauti kati ya gene knock out na knockdown.
