shRNA dhidi ya siRNA
Wakati wa mchakato wa mwingiliano wa RNA (RNAi), usemi wa jeni lengwa hupunguzwa kwa umaalum wa hali ya juu na uteuzi. RNAi ni mchakato wa asili, na unahusisha RNA ndogo inayoingilia (siRNA) na nywele fupi ya RNA (shRNA) na shRNA yenye kazi mbili. Hivi sasa, RNAi inatumika sana kama zana ya matibabu ya saratani ya kibinafsi. Utumiaji wa RNAi kimsingi hufanywa kwa siRNA iliyounganishwa kwa njia mbili ya kemikali na molekuli za shRNA za vekta. Ingawa molekuli hizi mbili zina matokeo sawa ya utendaji, zinatofautiana katika muundo wao; kwa hivyo, mifumo ya utendaji ya molekuli, njia za RNA, na athari zisizolengwa za molekuli hizi mbili pia hutofautiana.
shRNA
shRNA ni mfuatano wa molekuli ndogo ya RNA ambayo hugeuza pini iliyobana ambayo inaweza kutumika kunyamazisha usemi wa jeni lengwa wakati wa RNAi. Usemi wa shRNA hupatikana kwa vekta, ambayo inaweza kuwa virusi au bakteria au kwa utoaji wa plasmidi. Wao ni synthesized katika kiini cha seli na kusafirishwa kwa cytoplasm kwa michakato zaidi. Molekuli hizi zina njia za kukomaa sawa za miRNA; kwa hivyo usanisi wa miRNA umetoa msingi wa kuelewa usanisi wa shRNA. RNA polymerase II au III inaweza kunakili shRNA kupitia vikuzaji vya RNA polymerase II au III. Faida ya matumizi ya shRNA ni kwamba zina kiwango cha chini cha uharibifu na mauzo. Ubaya ni kwamba inahitaji vekta ya kujieleza, ambayo inaweza kusababisha masuala fulani ya usalama.
siRNA
siRNA ni molekuli za RNA zilizobanwa mara mbili zinazojumuisha jozi msingi 20- 25 kwa urefu. Hizi hutumika kwa ukandamizaji wa jeni kwa kunyamazisha jeni yoyote iliyo na mfuatano wa nyukleotidi katika njia ya RNAi. Kuporomoka kwa jeni kwa uhamishaji wa siRNA mara nyingi haifaulu kutokana na athari ya muda mfupi; hasa katika seli zinazogawanyika kwa kasi na ukandamizaji haudumu kwa muda mrefu. Ili kuondokana na suala hili, siRNA inarekebishwa kwa kuanzisha muundo wa nywele fupi. Molekuli hii iliyorekebishwa basi inajulikana kama shRNA. shRNA inapaswa kubadilishwa kuwa siRNA na Dicer ili kuendelea na kazi yake ya kawaida.
Kuna tofauti gani kati ya shRNA na siRNA?
• Tofauti na siRNA, shRNA ina muundo wa ziada wa pini ya nywele. shRNA ni toleo lililorekebishwa la siRNA.
• shRNA inahitaji vekta ya kujieleza, ilhali siRNA haihitaji.
• shRNA inaweza kutumika kwa kuangusha kwa muda mrefu huku siRNA inaweza kutumika tu kwa uharibifu wa jeni kwa muda mfupi.
• Tofauti na ukandamizaji wa jeni wa siRNA, ukandamizaji wa shRNA hudumu kwa muda mrefu, na ikiwa itaingizwa kupitia vekta ya virusi inayofaa, inaweza kutoa athari za kudumu za kunyamazisha jeni.
• Dicer inahitajika ili kubadilisha shRNA kuwa molekuli ya siRNA ili kutekeleza utendakazi wake wa kawaida.
