Tofauti kuu kati ya NGS na WGS ni kwamba mfuatano wa kizazi kijacho (NGS) ni teknolojia ya mfuatano ya kizazi cha pili ambayo ni ya juu, gharama ya chini, na ya haraka, huku mpangilio wa jenomu nzima (WGS) ni. mbinu ya kina ya kuchanganua DNA nzima ya jeni ya seli kwa wakati mmoja kwa kutumia mbinu za kupanga mpangilio kama vile mpangilio wa Sanger, mbinu ya bunduki au mpangilio wa juu wa utendakazi wa NGS.
Katika miongo michache iliyopita, uelewaji wa jenomu ya binadamu na wanyama wengine umeongezeka kwa kiasi kikubwa kutokana na ugunduzi wa mbinu za haraka za kupanga mpangilio na zana za bioinformatics. Mbinu za kawaida za kupanga mpangilio kama vile upangaji wa Sanger zilikuwa na mapungufu yake, ambayo yalitaka kubuniwa kwa mbinu mpya za upangaji wa haraka kama vile mpangilio wa kizazi kijacho (NGS) na mpangilio wa nanopore. Mbinu ya mpangilio wa jenomu nzima (WGS) ni mbinu ya hivi majuzi ambayo tayari inatumika katika miradi mingi ya utafiti wa jeni, kama vile mradi wa 100, 000 wa genomic wa Genomic England, Uingereza. Kwa hivyo, NGS na WGS ni mbinu mbili za mpangilio ambazo kwa sasa zinajumuisha katika miradi mingi ya jeni.
NGS ni nini?
NGS (mfuatano wa kizazi kijacho) ni teknolojia ya mfuatano ya kizazi cha pili ambayo ni ya juu zaidi, ya gharama nafuu na ya haraka. Hakuna ufafanuzi sahihi wa mpangilio wa kizazi kijacho. Lakini tunaweza kutofautisha wazi kutoka kwa mbinu za mpangilio wa msingi wa capillary. Mpangilio wa kizazi kijacho huruhusu upangaji wa molekuli ya DNA yenye ukubwa wa jumla ya zaidi ya jozi msingi milioni 1 katika jaribio moja. Inatoa kasi isiyokuwa ya kawaida na chaguzi za juu za upitishaji, kama vile kuruhusu mpangilio wa DNA ya watu wengi kwa wakati mmoja. Hii inafanikiwa kwa kupunguza kiwango cha athari za mpangilio wa mtu binafsi. Zaidi ya hayo, hii pia hupunguza ukubwa wa vifaa na kupunguza gharama ya vitendanishi kwa kila jibu.
Kielelezo 01: Majukwaa ya NGS
NGS ni mbinu ya mfuatano iliyosomwa kwa muda mfupi ambayo tayari imeleta mapinduzi katika nyanja ya utafiti wa kibaolojia. Zaidi ya hayo, NGS inatumika katika maeneo mbalimbali kama vile mpangilio wa genome wa de novo, upangaji wa jenomu nzima, uchanganuzi wa nukuu, upangaji mdogo wa RNA na RNA ndogo, ufuataji unaolengwa, na upangaji wa hali nzima.
WGS ni nini?
WGS (mfuatano wa jeni zima) ni mbinu ya kina ya kuchanganua DNA nzima ya jeni ya seli kwa wakati mmoja kwa kutumia mbinu za mpangilio kama vile mpangilio wa Sanger, mkabala wa bunduki, au upangaji wa matokeo ya juu ya NGS. Pia inajulikana kama mpangilio kamili wa jenomu au mpangilio kamili wa jenomu. Mpangilio wa jenomu nzima unajumuisha mfuatano wa kromosomu zote za DNA ya kiumbe pamoja na DNA katika mitochondria, na kwa mimea, DNA katika kloroplast kwa wakati mmoja. WGS huwawezesha wanasayansi kusoma mlolongo kamili wa herufi zote zinazounda seti kamili ya DNA. WGS inayotumia jukwaa la NGS inatarajiwa kuleta mabadiliko katika usanidi wa kimatibabu.
Kielelezo 02: WGS dhidi ya Mfuatano wa Kihierarkia wa Shotgun
€, tafiti za mabadiliko na upangaji upya, tafiti nadra za uhusiano wa lahaja, na kutabiri uwezekano wa ugonjwa na mwitikio wa dawa.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya NGS na WGS?
- NGS na WGS ni mbinu mbili za mpangilio.
- Mbinu zote mbili hufuatana DNA au RNA.
- Mbinu hizi ni mpya na za kuaminika.
- Zote hutumika katika kutambua magonjwa na ugunduzi wa dawa.
Nini Tofauti Kati ya NGS na WGS?
NGS ni teknolojia ya mfuatano wa kizazi cha pili ya upangaji mpangilio ambayo ina uwezo wa juu, gharama ya chini, na ya haraka, wakati WGS ni mbinu ya kina ya kuchanganua DNA nzima ya genomic ya seli kwa wakati mmoja kwa kutumia mbinu za mpangilio kama vile. kama mpangilio wa Sanger, mbinu ya bunduki au mpangilio wa juu wa utendakazi wa NGS. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya NGS na WGS. Zaidi ya hayo, NGS inajumuisha mbinu za upangaji wa kizazi cha pili pekee huku WGS inajumuisha mbinu za upangaji za vizazi vya kwanza, vya pili na vya tatu.
Jedwali lifuatalo linaonyesha tofauti kati ya na NGS na WGS katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa ubavu.
Muhtasari – NGS dhidi ya WGS
Katika miongo iliyopita, mbinu tofauti za kupanga mpangilio zimetumika mara kwa mara katika utafiti wa kisasa wa molekuli. Na hata ni zana zenye nguvu sana kwa matumizi mengi ya kliniki. NGS na WGS ni mbinu mbili za mpangilio ambazo kwa sasa zinajumuisha katika miradi mingi ya jeni. NGS ni teknolojia ya kizazi cha pili ya kupanga mpangilio ambayo ni ya juu, gharama ya chini na ya haraka. Kwa upande mwingine, WGS ni mbinu ya kuchanganua DNA nzima ya jeni au DNA kamili ya jeni ya seli kwa wakati mmoja kwa kutumia mbinu za mpangilio kama vile mpangilio wa Sanger, mbinu ya bunduki, au mpangilio wa juu wa NGS. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya NGS na WGS.
