Tofauti kuu kati ya metagenomics na metatranscriptomics inategemea aina ya biomolecules zilizochunguzwa katika kila eneo. Metagenomics huchunguza DNA, mfuatano wake na tabia yake katika viumbe, huku metatranscriptomics huchunguza DNA iliyonakiliwa, hasa mifuatano ya mRNA na tabia yake katika viumbe.
Metagenomics na metatranscriptomics ni nyanja mbili ambazo zimepata umaarufu mkubwa kwa miaka kuhusiana na jumuiya ya viumbe vidogo. Ni muhimu katika utunzaji wa afya, tasnia na teknolojia ya kilimo. Metagenomics na metatranscriptomics huruhusu uchunguzi wa viumbe binafsi katika jumuiya na majukumu yao ya utendaji ambayo yana manufaa au madhara.
Metagenomics ni nini?
Metagenomics ni fani ya utafiti inayochunguza Deoxyribonucleic acid (DNA). Ni muhimu zaidi kwa jumuiya ya microbial. Pia, ni uwanja wa juu zaidi kwa kulinganisha na genomics. Katika genomics, uchambuzi wa DNA ya viumbe fulani hufanyika. Hata hivyo, metagenomics inahusisha uchanganuzi wa nyenzo za kijeni katika jumuiya ya viumbe. Kwa hivyo, hii inaruhusu kusoma tabia ya jamii ya viumbe inayohusiana na hali moja au mazingira moja.
Kielelezo 01: Metagenomics
Mbinu kuu inayohusika katika tafiti za metagenomics ni Next Generation Sequencing (NGS) inayotumia teknolojia ya safu ndogo. Mbinu za NGS zinaweza kuchanganua viumbe vingi katika mmenyuko mmoja kwa kuwepo au kutokuwepo kwa mfuatano maalum wa DNA. Mifuatano hii ya DNA inaweza kuwajibika kwa hali moja ya ugonjwa au hali ya mazingira. Kwa hivyo, kwa kutumia ujuzi wa metagenomic, uchunguzi wa viumbe unaweza kufanywa kwa urahisi na kwa usahihi. Mfuatano wakati wa NGS hufanyika kwa usomaji mfupi na uwekaji wasifu wa DNA ya viumbe hufanyika. Mfuatano wa DNA wa miaka ya 16 ni mfuatano maarufu uliofanyiwa utafiti katika metagenomics kuhusu vijiumbe.
Kufuatia mpangilio wa jamii ya viumbe, upangaji wa mfuatano unapaswa kufanywa. Zana kama vile zana ya Mfuatano wa Msingi wa Upangaji wa Eneo Lako (BLAST) inatumika kutimiza jukumu la kupanga. Kufuatia mpangilio, mti wa filojenetiki hutoa uhusiano wa kila kiumbe katika jamii na maelezo kuhusu tabia yake.
Metatranscriptomics ni nini?
Metatranscriptomics ni fani ya utafiti inayoshughulikia unukuzi wa kiumbe. Nakala hii inajumuisha mfuatano mzima wa RNA unaonakiliwa wakati wa unukuzi wa DNA. Mifuatano ya mRNA iliyopo kwenye nakala hutoa habari juu ya usemi wa kijeni. Metatranscriptomics ni uchanganuzi wa nakala nyingi kati ya watu au jumuiya.
Kielelezo 02: Uchambuzi wa Manukuu
Tafiti za Metatranscriptomics pia hutumia teknolojia ya safu ndogo kupata mfuatano wa mfuatano mfupi wa kusoma. Zaidi ya hayo, mettranscriptomics pia inahusisha uchanganuzi wa kina wa bioinformatics kwa kutumia zana za upatanishi na mbinu za kubuni miti. Walakini, uwanja wa metatranscriptomics ni ngumu zaidi kwa kulinganisha na metagenomics. Uchimbaji wa mRNA au RNA kwa ujumla sio rahisi kama inavyoonekana. Kwa kuwa RNA inakabiliwa na uharibifu na ina muda mfupi sana wa kuishi, matengenezo na uhifadhi wa haya inaweza kuwa swala linalowezekana.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Metagenomics na Metatranscriptomics?
- Metagenomics na metatranscriptomics ni mbinu za juu zaidi za kuchanganua jumuiya za viumbe, hasa jumuiya ndogo ndogo.
- Mbinu zote mbili hutumia teknolojia ya safu ndogo kubaini matokeo.
- Matokeo yaliyopatikana mara nyingi huchanganuliwa kwa kutumia mpangilio wa BLAST na miti ya Filojenetiki.
- Zaidi ya hayo, mbinu zote mbili hazilengi kiumbe kimoja, bali kundi au viumbe vya jumuiya.
- Mbali na hilo, dhana zote mbili pia huchunguzwa zaidi kuhusiana na vijidudu - sababu kuu ikiwa ni majukumu yao mbalimbali yaliyotekelezwa.
Nini Tofauti Kati ya Metagenomics na Metatranscriptomics?
Metagenomics na Metatranscriptomics huhusisha uchanganuzi wa chembe cha urithi katika jumuiya ya viumbe. Kwa hivyo, metagenomics inahusu mifumo na mfuatano wa DNA ilhali metatranscriptomics hurejelea uchanganuzi wa mRNA au DNA iliyonakiliwa. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya metagenomics na metatranscriptomics.
Aidha, utaratibu wa uchimbaji hutofautiana katika mbinu zote mbili; metagenomics inahusisha taratibu za uchimbaji wa DNA na metaranscriptomics inahusisha taratibu za uchimbaji wa RNA. Kwa hivyo, hii pia ni tofauti kubwa kati ya metagenomics na metatranscriptomics.
Infographic hapa chini ni muhtasari wa tofauti kati ya metagenomics na metatranscriptomics:
Muhtasari – Metagenomics vs Metatranscriptomics
Metagenomics na metatranscriptomics ni nyanja za utafiti ambazo huchanganua jamii ya viumbe kwa hali fulani. Kwa hivyo, metagenomics inahusu uchambuzi wa mlolongo wa DNA. Kinyume chake, metatranscriptomics inarejelea uchanganuzi wa mfuatano wa RNA au bidhaa za DNA zilizonakiliwa. Katika suala hili, metaranscriptomics huwezesha utambuzi wa usemi wa jeni kwa kesi fulani. Zote mbili ni muhimu katika kuchambua mabadiliko na athari zao. Hizi ni mbinu za haraka na za kuaminika zaidi zinazotumiwa katika utambuzi wa mapema. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya metagenomics na metatranscriptomics.
