Tofauti Muhimu – Uhamisho wa Bakteria dhidi ya Integrases za Retroviral
Nyenzo za kijeni zinazoweza kusafirishwa zimebadilika kwa mikakati miwili mikuu ya kuhama kutoka eneo moja hadi eneo lingine la ndani na kati ya jenomu. Njia moja ni kuhamisha kupitia molekuli ya RNA kabla ya kuundwa kwa molekuli ya DNA wakati njia nyingine inahusisha viambatisho vya DNA. Transposases na integrases ya virusi ni mifano ya nyenzo hizo za kijeni zinazoweza kupitishwa. Uhamisho wa bakteria hufunga hadi mwisho wa transposons na kuwezesha catalysis ya harakati ya transposon kwa sehemu nyingine ya jenomu kupitia taratibu mbalimbali. Viunga vya retroviral ni vimeng'enya vinavyosaidia katika kuunganishwa kwa nyenzo za kijeni za virusi vya retrovirus kama vile VVU kwenye nyenzo za kijeni (DNA) za seli mwenyeji inayoambukiza. Hii ndiyo tofauti kuu kati ya uhamishaji wa bakteria na viambatanisho vya retroviral.
Uhamisho wa Bakteria ni nini?
Transposase inaweza kufafanuliwa kuwa kimeng'enya kinachofungamana na mwisho wa transposons ambayo hurahisisha uchochezi wa uhamishaji wa uhamishaji hadi sehemu nyingine ya jenomu kupitia njia mbalimbali. Taratibu hizo ni pamoja na ‘utaratibu wa kukata na kubandika’ na ‘utaratibu wa upitishaji wa replicative’. Transposase ilianzishwa kwanza kwa njia ya uundaji wa kimeng'enya ambacho kinahitajika kwa uhamishaji wa transposon ya Tn3. Mikakati miwili muhimu imetumiwa na chembe za kijeni zinazoweza kuhamishwa kwa uhamisho kati ya jenomu au kutoka tovuti moja hadi nyingine. Usafirishaji kupitia sehemu ya kati ya RNA kabla ya usanisi wa nakala ya DNA ni mkakati mmoja huku mwingine ukifungwa kwa viunga vya DNA pekee. Athari za ujumuishaji ambazo zinahusika katika ujumuishaji wa vitu vyote viwili hufanyika kwa sababu ya vimeng'enya maalum. Kwa hivyo, katika mfano wa elementi za DNA, vimeng'enya hivi hujulikana kama transposases wakati katika mfano wa vipengele vya RNA, hujulikana kama integrases.
Unapolinganisha tofauti kati ya mikakati yote miwili ya uhamishaji, mchakato wa uwekaji unaonekana kuwa sawa kikemia. Lakini, ushahidi wa hivi majuzi unapendekeza kwamba ufanano fulani katika utaratibu wa ujumuishaji unaonekana katika maeneo ya mfuatano wa asidi ya amino ambayo huunda tovuti hai; motifu ya DDE. Familia tano za uhamishaji zinaainishwa kwa sasa lakini, idadi ya familia bado haijaongezeka na wahusika wapya wa uhamishaji. Familia hizo ni pamoja na DDE transposase, Tyrosine (Y) transposase, Serine (S) transposase, Rolling circle transposase, Reverse transcriptases/endonucleases (RT/En) n.k. Familia hizi hutumia mbinu za kipekee za kichocheo kwa kuvunja na kuunganishwa tena kwa DNA. Uhamisho wa DDE unahusisha katika utaratibu wa kukata na kubandika wa transposon ya awali na hubeba seti tatu za amino asidi zilizohifadhiwa ambazo ni; aspartate (D), aspartate (D) na glutamate (E). Upitishaji wa tyrosine pia huhusisha katika utaratibu wa kukata na kubandika kwa matumizi ya mabaki ya tyrosine, ambayo ni mahususi ya tovuti.
Kielelezo 01: Uhamisho wa Bakteria
Uhamisho wa serine huhusisha DNA ya kati ya duara na kutekeleza utaratibu wa kukata na kubandika kama ilivyo juu ya familia. Upitishaji wa mduara unaozunguka unahusisha katika utaratibu wa kunakili ambapo uzi mmoja unanakiliwa moja kwa moja kwenye tovuti inayolengwa kupitia urudufishaji wa DNA. Hii inahakikisha kwamba uzi wa kiolezo na uzi ulionakiliwa una uzi ambao umeunganishwa upya. Reverse transcriptases/endonucleases transposase ina njia mbalimbali za uhamishaji.
Retroviral Integrases ni nini?
Katika muktadha wa Retroviral Integrase, inachukuliwa kuwa kimeng'enya cha retroviral ambacho husaidia katika ujumuishaji wa nyenzo za kijeni za virusi vya retrovirus kama vile VVU kwenye nyenzo za kijeni (DNA) za seli ambayo imeambukizwa. Hizi integrasi za retroviral mara nyingi huchanganyikiwa na integrase za fagio. Mifano ya viambatanisho vya fagio ni λ fage integrase. Lakini hizi ni enzymes tofauti kabisa na hazipaswi kuchanganyikiwa nazo. Kuhusiana na malezi ya tata ya retroviral pre-integration, retroviral integrase ina jukumu kubwa. Protini za kuunganisha retroviral kwa kawaida huwa na vikoa vitatu (03) vya kanuni. Vikoa hivi vimeunganishwa na viunga vinavyonyumbulika.
Vikoa vitatu ni pamoja na kikoa cha N terminal kinachofunga zinki ambapo vifurushi vitatu vya helical huunganishwa na kuimarishwa kupitia uratibu kwa kuhusika kwa mawasiliano ya Zn2+, mkunjo wa RNase H. kikoa kikuu cha kichocheo na kikoa cha kuunganisha DNA cha C terminal, ambacho ni mkunjo wa SH3. Kwa uchunguzi na kupitia maelezo ya kibayolojia na ya kimuundo, inapendekeza kuwa muunganisho wa retroviral una uwezo wa kufanya kazi kama dimmer ya dimmers (tetramer). Katika muktadha wa multimerisation na binding DNA virusi, nyanja zote tatu za retroviral integrase protini. Kazi kuu ya integrase ya retroviral ni kuingiza nyenzo zake za kijeni ili kupangisha DNA. Hatua hii ni hatua muhimu zaidi katika uzazi wa virusi vya UKIMWI. Baada ya kuunganishwa kwa ufanisi, itakuwa katika DNA ya kromosomu ya seli kwa muda wake wote wa maisha.
Kielelezo 02: Retroviral Integrases
Kwa hivyo, ikiunganishwa hakuna kurudi kwa kisanduku. Miunganisho hii ya retroviral inahusisha katika uanzishaji wa athari mbili kuu ikiwa ni pamoja na usindikaji wa mwisho wa 3 na kuunganisha covalent. Wakati wa usindikaji wa mwisho wa 3, nyukleotidi 2-3 kutoka ncha zote 3 za DNA ya virusi huondolewa kwa nia ya kufichua dinucleotidi za CA za ncha 3 za DNA ya virusi, na wakati wa kuunganisha kwa ushirikiano, ncha 3' zilizochakatwa. DNA ya virusi imeunganishwa kwa ushirikiano kwenye DNA ya kromosomu mwenyeji.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Uhamisho wa Bakteria na Integrases ya Retroviral?
Uhamisho wa Bakteria na Viunganishi vya Retroviral vina mfuatano sawa wa asidi ya amino
Nini Tofauti Kati ya Uhamisho wa Bakteria na Viunganishi vya Retroviral?
Bacterial Transposases vs Retroviral Integrases |
|
| Bacterial Transposase ni kimeng'enya kinachofungamana hadi mwisho wa transposons huku kikiwezesha uchochezi wa uhamishaji wa uhamishaji hadi sehemu nyingine ya jenomu kupitia mifumo mbalimbali. | Retroviral Integrases inachukuliwa kuwa kimeng'enya cha retroviral ambacho husaidia katika ujumuishaji wa chembe chembe za urithi za retrovirusi kama vile VVU kwenye chembe za urithi (DNA) za seli iliyoambukizwa. |
| Mikoa ya Kuunganisha | |
| Maeneo mahususi ya juu ya kuunganisha yanahitajika kwa Uhamisho wa Bakteria. | Mfuatano wa nyukleotidi kidogo au hauhitajiki kwa kufunga. |
Muhtasari – Uhamisho wa Bakteria dhidi ya Retroviral Integrases
Uhamisho wa bakteria huzingatiwa kama kimeng'enya cha kurejesha virusi ambacho husaidia katika uunganishaji wa nyenzo za kijeni za virusi vya retrovirus kama vile VVU kwenye nyenzo za kijeni (DNA) za seli ambayo imeambukizwa. Mikakati miwili muhimu imetumiwa na chembe za urithi zinazoweza kuhamishwa kwa uhamisho kati ya jenomu au kutoka tovuti moja hadi nyingine. Familia tano za uhamishaji zinaainishwa kwa sasa lakini, idadi ya familia bado haijaongezeka na wahusika wapya wa uhamishaji. Retroviral Integrase, inachukuliwa kuwa kimeng'enya cha retroviral ambacho husaidia katika ujumuishaji wa nyenzo za kijeni za virusi vya retrovirus kama vile VVU kwenye nyenzo za kijenetiki (DNA) za seli iliyoambukizwa. Protini za kuunganisha retroviral kwa kawaida huwa na vikoa vitatu (03) vya kanuni. Kazi kuu ya integrase ya retroviral ni kuingiza nyenzo zake za kijeni ili kupangisha DNA. Hatua hii ni hatua muhimu zaidi katika uzazi wa virusi vya UKIMWI. Kwa hivyo, baada ya kuunganishwa hakuna kurudi kwa seli. Hii ndio tofauti kati ya Bacterial transposases na Retroviral Integrase.
Pakua PDF ya Bacterial Transposases vs Retroviral Integrases
Unaweza kupakua toleo la PDF la makala haya na uitumie kwa madhumuni ya nje ya mtandao kulingana na dokezo la manukuu. Tafadhali pakua toleo la PDF hapa: Tofauti Kati ya Uhamisho wa Bakteria na Integrases za Retroviral
