Tofauti Muhimu – Mlalo dhidi ya Wima Gel Electrophoresis
Gel electrophoresis ni mbinu ya kimaabara inayotumika katika chembe za urithi kutenganisha michanganyiko iliyo na DNA, RNA, na protini nyingine kulingana na chaji na ukubwa wa molekuli. DNA, RNA au protini zinazohitaji kutenganishwa kwa njia hii zinaendeshwa kupitia gel ambayo ina pores ndogo. Molekuli zinaendeshwa kupitia gel na shamba la umeme. Masi hupita kupitia pores ya gel, na kasi ya harakati ni kinyume chake kwa urefu wao. Kwa hiyo, molekuli zilizo na ukubwa wa chini wa Masi zitasonga kwa kasi zaidi kuliko molekuli zilizo na uzito wa juu wa Masi. Sehemu ya umeme inazalishwa na tofauti ya malipo katika ncha mbili za gel. Ncha moja ina chaji chanya, na ya pili ina chaji hasi. Kwa kuwa molekuli za DNA na RNA zimechajiwa vibaya, zitavutiwa kuelekea mwisho wa chaji chanya ya gel. Gel electrophoresis inaweza kuwa ya njia mbili tofauti: electrophoresis ya gel ya usawa na electrophoresis ya gel ya wima. Katika electrophoresis ya gel ya mlalo, gel iko katika mwelekeo wa usawa na imefungwa kwenye buffer inayoendelea inayoendesha ambayo iko ndani ya sanduku la gel yenyewe. Katika electrophoresis ya gel ya wima, mfumo wa buffer umeelekezwa kwa wima na hauendelei na vyumba viwili vilivyopo juu na chini na cathode na anode, kwa mtiririko huo. Hii ndiyo tofauti kuu kati ya elektrophoresis ya jeli ya mlalo na wima.
Horizontal Gel Electrophoresis ni nini?
Elektrophoresis ya jeli mlalo hutumia nadharia ya msingi kwa utengano wa DNA, RNA au molekuli za protini kulingana na saizi na chaji ya molekuli. Katika mbinu hii, gel iko katika mwelekeo wa usawa na imefungwa kwenye buffer ambayo inaendelea. Gel ya Agarose hutumiwa kutenganisha sanduku la gel katika sehemu mbili. Mwisho mmoja wa sanduku la gel una anode wakati mwisho mwingine una cathode. Wakati wa sasa unatumika, buffer inayotumiwa katika mbinu hii inaruhusu kuundwa kwa gradient ya malipo. Wakati malipo yanatumiwa, gel huwa na joto. Bafa pia hufanya kazi kama kipozezi, ambacho hudumisha halijoto katika viwango vya juu zaidi. Mzunguko wa bafa inayoendesha huzuia uundaji wa gradient ya pH. Mfumo usioendelea wa bafa hauwezi kutumika katika electrophoresis ya jeli ya mlalo kwani sehemu mbili za mfumo wa jeli huunganishwa na bafa inayoendesha. Acrylamide hutumiwa wakati wa gel electrophoresis kutenganisha mchanganyiko wa protini.
Kielelezo 01: Horizontal Gel Electrophoresis
Katika electrophoresis ya jeli ya mlalo, acrylamide haiwezi kutumika kwa kuwa kisanduku cha jeli kinakabiliwa na oksijeni. Kutokana na kuwepo kwa oksijeni, upolimishaji wa acrylamide umezuiwa, na hii inaingilia kati ya malezi ya gel. Electrophoresis ya jeli ya mlalo ni njia rahisi ambayo hutumika katika kutenganisha DNA na RNA.
Vertical Gel Electrophoresis ni nini?
Kitendo cha mbinu ya kielektroniki ya jeli ya wima hufanya kazi kulingana na nadharia ya msingi ya elektrophoresis ya jeli, lakini inachukuliwa kuwa changamano zaidi kuliko mbinu ya mlalo ya gel electrophoresis. Mbinu hii hutumia buffer isiyoendelea. Cathode iko kwenye chumba cha juu, na anode iko kwenye chumba cha chini. Electrodes zilizopo katika kila compartment hutoa shamba la umeme linalohitajika. Safu nyembamba ya gel hutiwa kati ya sahani mbili za kioo zilizowekwa. Kwa hiyo, sehemu ya juu ya gel imefungwa ndani ya chumba cha juu, na sehemu ya chini ya gel imefungwa kwenye chumba kilicho chini. Mara tu mkondo unapotumiwa, sehemu ndogo ya buffer huhamia kwenye chumba cha chini kutoka kwenye chumba cha juu kupitia gel. Ya sasa inayotumika katika mbinu hii ni ya vizio vya dakika.
Kielelezo 02: Wima Gel Electrophoresis
Katika elektrophoresis ya wima ya jeli, bafa hutiririka kupitia jeli pekee. Hii inaruhusu udhibiti sahihi wa gradient ya voltage wakati wa hatua ya kujitenga. Geli ya Acrylamide inaweza kutumika kwa sababu vyumba haviko wazi kwa oksijeni ya anga. Kwa sababu ya saizi ndogo ya pore ya jeli ya acrylamide, utengano sahihi unaweza kupatikana kwa mwonekano wa juu zaidi.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Electrophoresis ya Gel ya Mlalo na Wima?
- Mifumo yote miwili hufanya kazi kulingana na nadharia ya msingi ya gel electrophoresis.
- Anode na cathode hutumika kutoa sehemu ya umeme inayohitajika katika mifumo yote miwili.
Kuna Tofauti gani Kati ya Gel Electrophoresis ya Mlalo na Wima?
Horizontal vs Vertical Gel Electrophoresis |
|
Mlalo wa Gel Electrophoresis ni mbinu ya elektrophoresis ya jeli ambapo jeli huwa katika mkao mlalo. | Vertical Gel Electrophoresis ni mbinu ya gel electrophoresis ambapo jeli inaelekezwa wima. |
Bafa | |
electrophoresis ya jeli ya mlalo ina bafa inayoendelea. | Bafa inayoendeshwa haifanyiki katika elektrophoresis ya wima ya jeli. |
Matumizi ya Acrylamide | |
Acrylamide haiwezi kutumika kwa elektrophoresis ya jeli ya mlalo kwa kuwa kisanduku cha jeli kinakabiliwa na oksijeni ya angahewa. | Kwa kuwa jeli haikabiliwi na oksijeni ya anga kutokana na vyumba viwili tofauti, acrylamide inaweza kutumika kwa elektrophoresis ya wima ya jeli. |
Function | |
electrophoresis ya gel mlalo hutumiwa mara nyingi zaidi kutenganisha DNA na mchanganyiko wa RNA lakini si protini. | Elektrophoresis ya gel wima hutumika kutenganisha michanganyiko ya protini. |
Muhtasari – Horizontal vs Vertical Gel Electrophoresis
Elektrophoresis ya gel ni mbinu ya maabara ambayo hutumiwa sana katika utenganishaji wa michanganyiko iliyo na molekuli za DNA, RNA na protini. Kuna njia mbili za electrophoresis ya gel: electrophoresis ya gel ya usawa na ya wima. Katika electrophoresis ya gel ya mlalo, buffer inayoendesha ni endelevu wakati katika electrophoresis ya gel wima, haifanyiki. Hii ni tofauti kati ya electrophoresis ya gel ya usawa na ya wima. Mifumo yote miwili hufanya kazi kulingana na kanuni ya kawaida ya gel electrophoresis.
Pakua Toleo la PDF la Horizontal vs Vertical Gel Electrophoresis
Unaweza kupakua toleo la PDF la makala haya na uitumie kwa madhumuni ya nje ya mtandao kulingana na dokezo la manukuu. Tafadhali pakua toleo la PDF hapa Tofauti Kati ya Electrophoresis ya Gel Mlalo na Wima.