Tofauti kuu kati ya xylene cyanol na bromophenol blue ni kwamba katika 1% ya gel ya agarose, xylene sainoli huhamia polepole, ilhali bromophenol blue huhamia kwa kasi zaidi.
Xylene sainoli na bromophenol bluu ni muhimu kama viashirio vya rangi vinavyoweza kutumika katika kufuatilia mchakato wa electrophoresis ya gel ya agarose na polyacrylamide gel electrophoresis.
Xylene Cyanol ni nini?
Xylene sainoli ni kiashirio cha rangi ya kielektroniki au rangi ya kufuatilia. Ni muhimu katika ufuatiliaji mchakato wa agarose gel electrophoresis na polyacrylamide gel electrophoresis. Dutu hii inapochanganywa na sampuli, mkusanyiko wa dutu hii kwa kawaida huwa takriban 0.005% hadi 0.03%. Baadhi ya visawe ambavyo tunaweza kutumia kwa zilini sainoli ni pamoja na Asidi ya Bluu 147, sainoli ya zilini, sainoli ya zilini FF, silioni sainoli FF, n.k.
Mchanganyiko wa kemikali wa kiwanja hiki ni C25H27N2NaO 6S2 Uzito wa molari ya zilini sainoli ni 538.61 g/mol. Dutu hii inaweza kuhama kwa kasi ya takriban vipande vya DNA vya jozi ya kilobase 4 - 5 katika 1% ya geli za agarose. Walakini, hii inategemea bafa ambayo tunatumia. Kwa kawaida, sainoli ya zilini kwenye 6% ya jeli ya Polyacrylamide inaweza kuhama kwa kasi ya vipande 140 vya msingi vya DNA. Kwa upande mwingine, inaweza kuhama kwa asilimia 20 ya elektrophoresis ya jeli ya polyacrylamide inayotoa denaturing kwa kiwango cha besi 25 za oligonucleotide.
Idadi ya wafadhili wa dhamana ya haidrojeni ya sianoli ya zilini ni 2m, na hesabu ya vipokezi vya bondi ya hidrojeni ni 8. Hesabu ya dhamana inayoweza kupokezana ya kiwanja hiki inaweza kutolewa kama 7. Utata wa silianoli ya zilini unaweza kuelezewa kuwa nyuzi 1120. Ina idadi iliyobainishwa ya dhamana ya stereocenter ya 1.
Bromophenol Blue ni nini?
Bromophenol bluu ni kiashirio muhimu cha pH ambacho ni muhimu kama kiashirio cha rangi ya kielektroniki na rangi. Ina jina la kemikali 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. Fomula ya kemikali ya kiwanja hiki ni C19H10Br4O5 S. Uzito wa molar wa kiwanja hiki ni 669.96 g / mol. Haina harufu, na msongamano wake unaweza kutolewa kama 2.2 g/mL. Kiwango chake cha kuyeyuka ni nyuzi joto 273, na kiwango chake cha kuchemsha ni nyuzi 279 Celsius. Tunaweza kuitayarisha kwa kuongeza polepole bromini ya ziada kwenye myeyusho moto wa phenolsulfonphthaleini katika asidi ya glacial asetiki.
Bromophenol bluu ni muhimu kama kiashirio cha msingi wa asidi katika masafa kati ya pH 3.0 hadi 4.6. Inaweza kubadilika kutoka njano katika pH 3.0 hadi pH 4.6. Zaidi ya hayo, ni mmenyuko unaoweza kugeuzwa. Kimuundo, bromophenol bluu ni sawa na phenolphthalein.
Mbali na hilo, tunaweza kuitumia kama alama ya rangi kufuatilia mchakato wa electrophoresis ya gel ya agarose na polyacrylamide gel electrophoresis. Dutu hii inaweza kubeba chaji hasi katika pH ya wastani, ambapo inaweza kuhamia katika mwelekeo sawa na DNA au protini katika gel. Kiwango cha uhamiaji kinaweza kutofautiana kulingana na wiani wa gel na muundo wa bafa. Hata hivyo, katika gel ya agarose ya kawaida ya 1% katika bafa ya TAE ya muda 1 au bafa ya TBE, dutu hii huhamishwa kwa kasi sawa na kipande cha DNA cha takriban jozi 300 za msingi.
Kuna tofauti gani kati ya Xylene Cyanol na Bromophenol Blue?
Xylene sainoli na bromophenol bluu ni viashirio muhimu vya rangi. Tofauti kuu kati ya xylene sainoli na bromophenol bluu ni kwamba katika 1% ya gel ya agarose, sainoli ya zilini huhamia polepole, ilhali bromophenol bluu huhamia haraka zaidi.
Hapa chini kuna muhtasari wa tofauti kati ya zilini sainoli na bromophenol bluu katika umbo la jedwali kwa ulinganishi wa ubavu kwa upande.
Muhtasari – Xylene Cyanol dhidi ya Bromophenol Blue
Xylene sainoli na bromophenol bluu ni muhimu kama viashirio vya rangi vinavyotumika katika kufuatilia mchakato wa electrophoresis ya gel ya agarose na electrophoresis ya gel ya polyacrylamide. Tofauti kuu kati ya xylene cyanol na bromophenol blue ni kwamba katika 1% ya gel ya agarose, sainoli ya zilini huhama polepole ilhali bromophenol bluu huhamia haraka zaidi.
