Tofauti kuu kati ya homolojia na ufanano katika bioinformatics ni kwamba homolojia inarejelea taarifa kuhusu asili ya pamoja ya mageuzi ya mifuatano miwili ilhali ufanano unarejelea kiwango cha kufanana kati ya mifuatano miwili.
Bioinformatics ni fani ya sayansi inayochanganya biolojia, uhandisi wa habari, sayansi ya kompyuta, hisabati na takwimu ili kuchanganua na kufasiri data ya kibiolojia. Homolojia na mfanano ni istilahi mbili tunazotumia katika uwanja wa bioinformatics. Tunaweza kukokotoa ufanano kwa urahisi kama asilimia ya masalio sawa juu ya urefu fulani wa mpangilio. Hata hivyo, hatuwezi kukokotoa homolojia kwa kuwa inaweza kuwa kweli au si kweli na kwa kawaida hutegemea nadharia tete inayotumika.
Homology ni nini katika Bioinformatics?
Homolojia katika bioinformatics inarejelea homolojia ya kibayolojia kati ya DNA, RNA na mfuatano wa protini ambayo hufafanuliwa kulingana na sifa za pamoja za mababu katika mti wa mageuzi wa maisha. Kwa maneno mengine, ni asili ya kawaida ya mageuzi ya mifuatano miwili. Sababu ya tukio kama hilo inaweza kuwa kutokana na matukio ya ubainifu (othologi), matukio ya uhamishaji jeni mlalo (xenologs) au matukio ya kurudia (paralogi).
Kielelezo 01: Mpangilio wa Mfuatano Nyingi
Inawezekana kubainisha homolojia kati ya DNA, RNA au protini kwa ufanano wao wa asidi ya amino au mfuatano wa nyukleotidi. Usawa muhimu hutumika kama sifa dhabiti ya kukisia kwamba mifuatano miwili inahusiana na mfuatano wa kawaida wa mababu wenye mabadiliko ya mageuzi. Mipangilio ya mifuatano mingi inaonyesha maeneo ya kila mfuatano yenye asili ya kufanana.
Ni Nini Kufanana katika Bioinformatics?
Katika maelezo ya kibayolojia, ufanano hutathmini ufanano kati ya protini mbili au mfuatano wa nyukleotidi. Kuna hatua mbili kuu za mchakato huu. Hatua ya awali ni upatanishaji wa busara wa jozi, ambao husaidia kupata upatanishi bora kati ya mifuatano miwili (pamoja na mapengo) kwa kutumia algoriti kama vile BLAST, FastA, na LALIGN. Baada ya usawazishaji wa jozi, ni muhimu kupata vigezo viwili vya upimaji kutoka kwa kila kulinganisha kwa jozi. Wao ni utambulisho na kufanana. Katika BLAST, utafutaji unaofanana hujulikana kama chanya.
Kielelezo 02: Mpangilio wa Pande zote
Mabadiliko ya kihafidhina hutokea wakati asidi ya amino inabadilika na kuwa mabaki sawa huku ikihifadhi sifa za fizikia. Kwa mfano, ikiwa arginine itabadilika na kuwa lysine kwa chaji chanya ya +1, inakubalika kwa kuwa asidi ya amino mbili zinafanana kimaumbile na hazibadilishi protini iliyotafsiriwa. Kwa hivyo, vipimo vya kufanana hutegemea vigezo vya jinsi mabaki mawili ya asidi ya amino yanahusiana.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Homolojia na Usawa katika Bioinformatics?
- Homolojia na mfanano ni maneno mawili ya kiufundi tunayokutana nayo katika bioinformatics.
- Zaidi ya hayo, maneno yote mawili yanarejelea uchanganuzi wa molekuli ya mfuatano.
Nini Tofauti Kati ya Homolojia na Usawa katika Bioinformatics?
Homolojia inarejelea taarifa kuhusu asili ya asili ya mageuzi ya mifuatano miwili huku ufanano unarejelea kiwango cha kufanana kati ya mifuatano miwili. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya homolojia na kufanana katika bioinformatics. Kwa kuongeza, homolojia haiwezi kuhesabiwa kwa kuwa inaweza kuwa kweli au si kweli na kwa kawaida hutegemea dhana ilhali ufanano unaweza kuhesabiwa kwa urahisi kama asilimia ya masalia sawa katika urefu fulani wa upatanishi. Kwa hivyo, hii ni tofauti kubwa kati ya homolojia na ufanano katika bioinformatics.
Infografia ifuatayo inaorodhesha tofauti kati ya homolojia na ufanano katika bioinformatics.
Muhtasari – Homolojia dhidi ya Usawa katika Bioinformatics
Kwa ufupi, tofauti kuu kati ya homolojia na ufanano katika bioinformatics iko katika fasili zake. Homolojia ni kauli ya asili ya kawaida ya mageuzi ya mifuatano miwili ilhali kufanana ni kufanana kati ya mifuatano miwili. Homolojia hutokea kutokana na orthologs, paralogs, na xenologs. Wakati wa kuamua kufanana, inawezekana kutumia algoriti kama vile FastA, BLAST, na LALIGN. Homolojia haiwezi kuonyeshwa kama hesabu, lakini ufanano unaweza kuonyeshwa kama asilimia ya masalio sawa katika urefu fulani wa mpangilio. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya homolojia na ufanano katika bioinformatics.
