Tofauti Muhimu – Gel ya Kurundika dhidi ya Geli ya Kutenganisha
Masharti ya kuweka jeli na jeli ya kutenganisha hutumika katika kufafanua mbinu ya SDS-PAGE. SDS-PAGE au sodiamu dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis ni mbinu ya kimaabara ambayo hutumiwa kutenganisha molekuli za protini kulingana na uzito wa molekuli. Nadharia nyuma ya mbinu hiyo ni kwamba protini zilizo na uzito tofauti wa molekuli zinaonyesha viwango tofauti vya uhamiaji; molekuli za uzani wa chini wa molekuli huhama haraka ilhali molekuli za uzito wa juu huhama polepole. Kati ya uhamiaji ni gel. Kuna aina mbili za jeli zinazoitwa gel ya kuweka na gel ya kutenganisha. Tofauti kuu kati ya jeli ya kuweka mrundikano na jeli ya kutenganisha ni kwamba pH ya jeli ya kuweka ni 6.8 ambapo pH ya jeli inayotenganisha ni 8.8.
Jeli ya Stacking ni nini?
Jeli ya kutundika ni jeli ya Polyacrylamide iliyokolea kidogo ambayo huwekwa juu ya jeli ya kutengenezea iliyokolea zaidi (gel ya kutenganisha) katika mbinu ya SDS-PAGE. Gel ya stacking hutumiwa kuboresha azimio la electrophoresis. Azimio huongezeka kwa sababu ya tofauti kati ya viwango vya gel ya kuweka na kusuluhisha gel ambayo huathiri protini katika sampuli. Kwa kuwa mkusanyiko wa Polyacrylamide katika gel ya kuweka ni ya chini, saizi ya pore ni kubwa zaidi. Hii pia husaidia katika kuongeza utengano.
Jeli ya kutundika ni jeli ya Polyacrylamide iliyolegea yenye matundu makubwa ya takriban 7% ya Polyacrylamide. Pores hizi hazifanyi kazi kama kizuizi kikubwa kwa molekuli kubwa za protini. Kwa hivyo gel hii huathiri kidogo uhamaji wa protini hizo. Hii hufanya utengano kulingana na uhamaji na saizi ya protini kwa kuziweka kati ya geli mbili.
Kielelezo 01: SDS-PAGE Acrylamide Gel
PH ya jeli ya kutundika ni 6.8. PH yake ni tindikali kuliko ile ya kusuluhisha gel kwa vitengo 2 vya pH. pH hii inamaanisha nguvu ya chini ya ioni kwa hivyo upinzani wa juu wa umeme. Hii huchochea uhamaji wa protini kuliko chembe chembe zingine zilizochaji zilizopo kwenye jeli.
Jeli ya Kutenganisha ni nini?
Jeli ya kutenganisha au jeli ya kutengenezea ya SDS-PAGEtechnique ni jeli ya Polyacrylamide iliyokolezwa sana ambayo huwekwa juu ya jeli ya kutundika iliyojilimbikizia kidogo. Gel ya kutenganisha ina kiasi kikubwa cha polyacrylamide (10%). PH ya jeli hii hudumishwa kama pH=8.8, ambayo ni kiwango cha juu cha pH kuliko ile ya jeli ya kutundika.
Kielelezo 02: Kifaa cha Gel Electrophoresis
Molekuli za protini zinapofika kwenye jeli inayotenganisha, uhamaji wa molekuli hizo hupunguzwa kasi kwa sababu jeli inayotenganisha ni jeli ya mkusanyiko wa juu yenye pore ndogo ambayo inaweza kufanya kama kizuizi kikubwa kwa mwendo wa molekuli za protini.. Kupunguza kasi huku huruhusu protini nyingine kuhama polepole ili kupatana, hivyo kusababisha mkanda mwembamba, uliokolea katikati ya geli hizo mbili.
Je, Kuna Uhusiano Gani Kati ya Gel ya Kurundika na Geli ya Kutenganisha?
Jeli ya Kupakia na aina ya Geli ya Kutenganisha hutumika katika kifaa kimoja
Kuna tofauti gani kati ya Gel ya Kurundika na Geli ya Kutenganisha?
Geli ya Kurundika dhidi ya Geli ya Kutenganisha |
|
| Jeli ya kutundika ni jeli ya Polyacrylamide iliyokolea kidogo ambayo huwekwa juu ya jeli ya kutengenezea iliyokolea zaidi (gel ya kutenganisha) katika mbinu ya SDS-PAGE. | Jeli ya kutenganisha au jeli ya kutengenezea ya mbinu ya SDS-PAGE ni jeli ya Polyacrylamide iliyokolezwa sana ambayo huwekwa juu ya jeli ya kutundika iliyokolea kidogo. |
| Uwekaji | |
| Jeli ya kutundika huwekwa kwenye jeli ya kutengenezea (kutenganisha). | Jeli ya kutenganisha huwekwa chini ya kontena inayotumika kwa gel electrophoresis. |
| Mazingira | |
| Msongamano wa jeli ya kutundika ni juu. | Mkusanyiko wa jeli ya kutenganisha ni mdogo. |
| Maudhui ya Polyacrylamide | |
| Jeli ya kutundika ina takriban 7% ya polyacrylamide. | Jeli ya kutenganisha ina takriban 10% polyacrylamide. |
| pH | |
| PH ya jeli ya kutundika ni 6.8. | PH ya jeli ya kutenganisha ni 8.8. |
| Ukubwa wa Matundu | |
| Mitundu mikubwa ya vinyweleo ipo kwenye jeli ya kutundika. | Vitundu vidogo vidogo vipo katika kutenganisha jeli. |
| azimio | |
| Jeli ya kutundika hutoa mwonekano bora zaidi. | Jeli ya kutenganisha inatoa mwonekano mbaya. |
Muhtasari – Gel ya Kupakia dhidi ya Geli ya Kutenganisha
Jeli ya kutundika na jeli ya kutenganisha ni aina mbili za jeli za Polyacrylamide zinazotumiwa kupata mtengano bora wa molekuli za protini katika sampuli fulani. Tofauti kati ya jeli ya kuweka mrundikano na jeli ya kutenganisha ni kwamba pH ya jeli ya kutundika ni 6.8 ambapo pH ya jeli inayotenganisha ni 8.8.
