Tofauti Muhimu – Kutoka dhidi ya Mfuatano wa RNA
Mfuatano wa asidi ya nyuklia ni mbinu inayobainisha mpangilio wa nyukleotidi katika kipande fulani cha DNA au RNA ya kiumbe. Mfuatano ni muhimu katika kutambua muundo wa DNA na RNA wa seli na kutofautisha jeni fulani ambazo zina kanuni za protini zinazofanya kazi; kwa hivyo, mpangilio unaweza kutumiwa kuelewa mabadiliko ya jeni na usemi wa jeni. Mbinu ya Upangaji Sanger au mbinu za juu zaidi za upangaji wa kizazi kijacho ni mbinu za mpangilio ambazo hutumiwa kwa kawaida. Mfuatano wa exome ni mfuatano wa seti kamili ya exoni au maeneo ya usimbaji ya DNA yaliyopo katika kiumbe ilhali upangaji wa RNA ni utaratibu wa upangaji wa asidi ya Ribonucleic (RNA). Hii ndiyo tofauti kuu kati ya exome na mpangilio wa RNA.
Mfuatano wa Exom ni nini?
Exome ni kikundi kidogo cha jenomu ambacho kinajumuisha jeni za usimbaji za kiumbe fulani. Jeni za usimbaji huitwa kama exoni na hunakiliwa katika mRNA na kisha kutafsiriwa katika mfuatano wa asidi ya amino. Wakati wa marekebisho ya baada ya unukuzi, utaratibu wa kuunganisha RNA katika yukariyoti huondoa introni (maeneo yasiyo ya usimbaji), na exoni hubakia. Kuna mbinu mbili kuu ambazo ufuataji wa exome unafanywa: suluhisho kulingana na safu.
Katika mpangilio wa exome kulingana na suluhu, sampuli za DNA hugawanywa kwa kutumia vimeng'enya vya kizuizi au mbinu ya kimakenika na kubadilishwa na joto. Katika mbinu hii, uchunguzi wa oligonucleotide wa biotini (baiti) hutumiwa kuchanganya kwa kuchagua na maeneo lengwa katika jenomu. Shanga za streptavidin za magnetic hutumiwa kwa hatua ya kumfunga. Kufunga kunafuatwa na hatua ya kuosha ambapo mlolongo usio na mipaka na usiolengwa huoshwa. Malengo yanayofungamana hukuzwa kwa kutumia Polymerase Chain reaction (PCR) na kisha kupangwa kwa kutumia upangaji wa Sanger au mbinu za Kufuatana za Kizazi Kinachofuata.
Kielelezo 01: Mpangilio wa Exhome
Mbinu ya msingi wa safu pia ni sawa na mbinu ya msingi ya suluhu, isipokuwa kwamba vipande vya DNA hunaswa katika safu ndogo, kisha hatua za kufunga na kuosha hufuata kabla ya kupangwa.
Mfuatano wa exome hutumika katika matumizi mengi kama vile utambuzi wa kinasaba wa magonjwa, katika tiba ya jeni, katika kutambua viashirio vipya vya vinasaba, katika kilimo kutambua sifa mbalimbali za manufaa za kilimo na katika taratibu za uenezaji wa mimea.
Mfuatano wa RNA ni nini?
Mfuatano wa RNA unatokana na nukuu, ambayo ni manukuu kamili ya kisanduku. Malengo makuu ya mpangilio wa RNA ni kuorodhesha aina zote za nakala, ikijumuisha mRNA, RNA isiyoweka misimbo, na RNA ndogo, ili kubainisha muundo wa unukuzi wa jeni na kubainisha viwango vya kujieleza vya kila nakala wakati wa kuunda. Wakati wa upangaji wa RNA, teknolojia za mseto (ambazo zilikuwa DNA ya ziada inayotokana na mfuatano wa mRNA iliyokomaa) hapo awali ilitumiwa kupanga mfuatano. Kwa sasa, mbinu sahihi zaidi na ya hali ya juu zaidi inatumika kwa mpangilio wa RNA.
Kielelezo 02: Mfuatano wa RNA
Katika mpangilio wa RNA, sampuli ya RNA ambayo inaweza kuwa jumla ya RNA au RNA iliyogawanywa hubadilishwa hadi DNA yake ya ziada (cDNA) kwa kutumia unukuzi wa kinyume, na maktaba ya cDNA hutayarishwa. Kila kipande cha cDNA kimeunganishwa kwa adapta pande zote mbili (mfuatano wa mwisho wa jozi) au upande mmoja (mfuatano wa mwisho mmoja). Mfuatano huu wenye lebo hupangwa kwa kutumia mpangilio wa Sanger au kizazi kijacho, kama vile ufuataji wa exome.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Exome na Mpangilio wa RNA?
- Vipande vifupi vilivyochaguliwa au seti nzima ya DNA / RNA inaweza kutumika kwa mpangilio wa Exome au RNA.
- Vipande vilivyofuatana vimehifadhiwa katika maktaba.
- Mfuatano wa sanger au mpangilio wa Kizazi Kijacho unaweza kutumika.
- Zote ni mbinu za kupanga mpangilio wa ndani.
- Vipande vilivyofuatana vinaweza kubainishwa na lebo za fluorescent.
Kuna tofauti gani kati ya Exome na Mpangilio wa RNA?
Exome vs RNA Sequencing |
|
| Mfuatano wa Exome ni mfuatano wa seti kamili ya exoni au maeneo ya usimbaji ya DNA yaliyopo kwenye kiumbe hai. | Mfuatano wa RNA unarejelea utaratibu wa upangaji wa asidi ya Ribonucleic (RNA); nakala. |
| Sampuli ya Kuanza | |
| Genomic DNA ni sampuli ya kuanzia ya mpangilio wa exome. | RNA ndiyo sampuli ya kuanzia ya mpangilio wa RNA. |
| Muundo | |
| Hii ina maeneo ya usimbaji pekee ya jumla ya DNA inayojulikana kama Exons | Hii ina RNA-mRNA / transcriptome. |
| Mfuatano | |
| Kuna mbinu kuu mbili za mpangilio wa exome; msingi wa suluhisho na teknolojia za msingi za safu. | Mfuatano wa RNA hufanywa kupitia utayarishaji wa maktaba ya cDNA kwa kutoa jumla ya RNA au RNA iliyogawanyika. |
Muhtasari – Kutoka dhidi ya Mfuatano wa RNA
Exome ni seti kamili ya maeneo ya usimbaji ya kiumbe na mbinu zinazohusika katika kubaini mpangilio kamili wa nyukleotidi ya Exome inajulikana kama upangaji wa exome. Mpangilio wa RNA ni mbinu inayohusika katika uamuzi wa mpangilio wa nyukleotidi wa RNA ya kiumbe. Hii ndio tofauti kati ya exome na mpangilio wa RNA.
Pakua Toleo la PDF la Exome dhidi ya Mpangilio wa RNA
Unaweza kupakua toleo la PDF la makala haya na uitumie kwa madhumuni ya nje ya mtandao kulingana na dokezo la manukuu. Tafadhali pakua toleo la PDF hapa Tofauti Kati ya Exome na Mpangilio wa RNA
