Tofauti kuu kati ya mfanano na utambulisho katika upatanishaji wa mfuatano ni kwamba mfanano ni kufanana (kufanana) kati ya mifuatano miwili kwa kulinganisha wakati utambulisho ni idadi ya herufi zinazolingana haswa kati ya mfuatano mbili tofauti.
Bioinformatics ni nyanja ya sayansi inayohusisha taaluma mbalimbali ambayo inahusisha zaidi biolojia ya molekuli na jenetiki, sayansi ya kompyuta, hisabati na takwimu. Mpangilio wa mfuatano ni neno kuu katika bioinformatics. Ni utaratibu ambao mfuatano wa DNA, RNA au protini hupangwa ili kutambua maeneo ya kufanana ambayo ni tokeo la uhusiano wa kiutendaji, kimuundo au mageuzi kati ya mfuatano. Mwishoni mwa upangaji, zitawasilishwa kama safu ndani ya tumbo. Ili kupatanisha herufi zinazofanana katika safu-wima zinazofuatana, mapengo yaliyoingizwa yapo kati ya masalio.
Kufanana ni Nini?
Kufanana katika upangaji wa mfuatano ni mfanano kati ya mifuatano miwili inapolinganishwa. Ukweli huu unategemea utambulisho wa mlolongo. Kufanana kunaonyesha kiwango ambacho mabaki yamepangwa. Kwa hivyo, mlolongo sawa una sifa zinazofanana. Katika bioinformatics, kufanana ni zana ya kutathmini kufanana kati ya protini mbili.
Kielelezo 01: Kufanana katika Mpangilio wa Mfuatano
Kuna hatua kuu mbili za kupanga mchakato wa upangaji. Hatua ya awali ni upatanishaji wa busara wa jozi, ambao husaidia kupata upatanishi bora kati ya mifuatano miwili (pamoja na mapengo) kwa kutumia algoriti kama vile BLAST, FastA, na LALIGN. Algorithm inayolingana hupata idadi ya chini ya shughuli za kuhariri; in-dels na vibadala ili kuoanisha mfuatano mmoja na mfuatano mwingine. Baada ya usawazishaji wa jozi, ni muhimu kupata vigezo viwili vya upimaji kutoka kwa kila kulinganisha kwa jozi. Ni utambulisho na kufanana.
Identity ni nini?
Kitambulisho katika mpangilio wa mfuatano ni idadi ya herufi zinazolingana haswa kati ya mfuatano mbili tofauti. Kwa hivyo, mapungufu hayahesabiki wakati wa kutathmini utambulisho. Kipimo kinachukuliwa kuwa kinahusiana na mfuatano mfupi kati ya mlolongo huo mbili. Inamaanisha kwa kiasi kikubwa kuwa ina athari ambapo utambulisho wa mfuatano sio wa mpito. Ikiwa X=Y na Y=Z, basi X si lazima iwe sawa na Z. Hii inatolewa kulingana na kipimo cha umbali wa utambulisho.
Kielelezo 02: Utambulisho katika Mpangilio wa Mfuatano
Kwa mfano, X ina mfuatano wa AAGGCTT, Y ina mfuatano wa AAGGC na Z ina mfuatano wa AAGGCAT. Utambulisho kati ya X na Y ni 100% {5 nyukleotidi zinazofanana / min[urefu(X), urefu(Y)]}. Utambulisho kati ya Y na Z pia ni 100%. Lakini utambulisho kati ya X na Z ni 85% pekee {(nyukleotidi 6 zinazofanana / 7)}.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Kufanana na Utambulisho katika Mpangilio wa Mfuatano?
- Ulingana na utambulisho ni istilahi mbili tunazotumia katika upatanishi wa mfuatano.
- Pia, zinarejelea mfanano kati ya mifuatano miwili.
- Aidha, tunazieleza kama asilimia ya thamani.
Nini Tofauti Kati ya Kufanana na Utambulisho katika Mpangilio wa Mfuatano?
Kufanana katika upangaji hueleza mfanano kati ya mifuatano miwili inapolinganishwa huku utambulisho katika upangaji wa mfuatano unaonyesha kiasi cha herufi zinazolingana haswa kati ya mfuatano mbili tofauti. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya mfanano na utambulisho katika mpangilio wa mfuatano.
Muhtasari – Kufanana dhidi ya Utambulisho katika Mpangilio wa Mfuatano
Mpangilio wa mfuatano husaidia kutambua maeneo ya ufanano katika DNA, RNA au protini inayotokana na uhusiano wa kiutendaji, kimuundo au mageuzi kati ya mfuatano. Kwa hivyo, kufanana na utambulisho ni maneno mawili muhimu katika muktadha wa upatanishi wa mfuatano. Tofauti kuu kati ya istilahi hizi mbili ni kwamba kufanana ni mfanano kati ya mifuatano miwili kwa kulinganisha ilhali utambulisho ni idadi ya herufi zinazolingana haswa kati ya mfuatano mbili tofauti. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya kufanana na utambulisho katika upatanishi wa mfuatano.
