Tofauti kuu kati ya mpangilio mzima wa jenomu na upangaji wa exome ni kwamba mpangilio wa jenomu nzima hufuatana na jenomu nzima ya kiumbe hai huku mfuatano wa exome ukifuata tu exome au jeni za usimbaji protini za kiumbe hai.
Mfuatano ni mbinu inayobainisha mpangilio sahihi wa nyukleotidi katika molekuli mahususi ya DNA. Inaakisi tu mpangilio sahihi wa misingi minne; adenine (A), guanini (G), cytosine (C) na thymine (T) katika kipande cha DNA. Kuna mbinu kadhaa za kupanga mpangilio kama vile mpangilio wa Sanger, upangaji wa kizazi kijacho, n.k. Zaidi ya hayo, ama jenomu kamili ya kiumbe (mfuatano wa jenomu nzima) au ni jeni za usimbaji wa protini pekee kwenye jenomu (exome sequencing) zinaweza kufanyiwa mfuatano.
Mfuatano Mzima wa Jenomu ni nini?
Genomu ya binadamu ina takriban jozi bilioni tatu msingi za DNA. Mpangilio mzima wa jenomu ni njia inayofuatana na jenomu kamili ya kiumbe. Kwa hivyo, katika mpangilio mzima wa jenomu, jambo linalozingatiwa ni mkusanyo mzima wa molekuli za DNA ikijumuisha exomes, introns, nafasi za interjenic, n.k. Zaidi ya hayo, mpangilio mzima wa mpangilio wa jenomu sio tu jenomu inayokaa ndani ya kiini bali pia DNA ya mitochondrial..
Kielelezo 01: Mfuatano wa Jeni Nzima
Katika kutayarisha mfuatano huu, hatua ya kwanza ni kutoa DNA nzima. Kisha, DNA iliyotolewa hupitia utaratibu wa kupanga kwa kutumia njia inayofaa ya mpangilio. Kwa kuchanganua mlolongo unaotokana, kwa kutumia zana ya bioinformatics, tunaweza kujua magonjwa adimu, saratani, magonjwa ya kuambukiza, n.k.
Mfuatano wa Exom ni nini?
Exome ni sehemu ya jenomu iliyo na takriban 1.5% ya jenomu, na ni mkusanyiko wa exoni. Exons ni mfuatano ambao unakili katika mRNA na kisha hadi bidhaa ya mwisho ya protini. Kwa hivyo, upangaji wa exome hufuata mpangilio mzima wa usimbaji wa protini katika jenomu. Mpangilio wa exome unaonyesha matatizo ya kijenetiki kwa kuwa matatizo mengi ya kijeni hutokea kutokana na mabadiliko ya jeni za usimbaji wa protini. Kwa hivyo, michakato ya utambuzi wa shida za kijeni mara nyingi hutumia mpangilio wa exome kama njia ya kugundua ugonjwa. Pia, wakati wa kulinganisha na programu nzima ya kupanga mpangilio wa jenomu kwa ajili ya majaribio ya kijeni, mpangilio wa exome huchukua muda mfupi kuajiri na ni wa gharama nafuu.
Kielelezo 02: Mpangilio wa Exhome
Katika mpangilio wa exome, kwanza, ni muhimu kuchagua tu mfuatano wa usimbaji wa protini kutoka kwa jumla ya DNA. Kumbuka kuwa wanadamu wana takriban mfuatano wa usimbaji wa protini 180000. Kisha, exome hupangwa kwa kutumia mbinu ya upangaji wa matokeo ya juu.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Mpangilio Mzima wa Jeni na Mfuatano wa Exom?
- Mfuatano Mzima wa Jenomu na Mfuatano wa Exome ni matumizi mawili ya mfuatano.
- Njia zote mbili ni muhimu katika kubainisha mpangilio sahihi wa mfuatano wa nyukleotidi katika mbinu zote mbili.
- Pia, bioinformatics husaidia katika mbinu zote mbili kuchanganua data.
Kuna Tofauti Gani Kati ya Mfuatano Mzima wa Jeni na Mfuatano wa Exom?
€Kwa hivyo, hii ndio tofauti ya kimsingi kati ya mpangilio mzima wa jenomu na mpangilio wa exome. Pia, ingawa mbinu zote mbili zinatumika sana kubainisha mpangilio sahihi wa mfuatano wa nyukleotidi, mpangilio mzima wa jenomu ni wa gharama na unatumia muda mwingi kuliko ufuataji wa exome.
Infografia iliyo hapa chini inaweka jedwali la tofauti kati ya mpangilio mzima wa jenomu na mfuatano wa exome.
Muhtasari – Mpangilio Mzima wa Jenomu dhidi ya Mfuatano wa Exom
Mfuatano unaonyesha mpangilio sahihi wa besi katika kipande cha DNA na inaweza kuwa mfuatano mzima wa jenomu au mfuatano wa exome. Hapa, mpangilio mzima wa jenomu hufuatana na jenomu kamili ya kiumbe huku mfuatano wa exome ukifuata mfuatano wa usimbaji wa protini katika jenomu. Kwa kuzingatia matumizi yao, mpangilio mzima wa jenomu husaidia katika kuchanganua upotofu wa kijenetiki kama vile tofauti za nukleotidi moja, ufutaji, uwekaji, n.k. katika jenomu nzima huku ufuataji wa exome ukisaidia katika kugundua magonjwa ya kijeni. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kati ya mpangilio mzima wa jenomu na mpangilio wa exome.
