Tofauti Muhimu – Exome vs Transcriptome
Jini ina maeneo ya usimbaji na yasiyo ya kusimba ndani yake. Mfuatano wa usimbaji hujulikana kama exons, na mfuatano usio wa usimbaji hujulikana kama introns. Mlolongo wa nyukleotidi wa exoni za jeni huwakilisha kanuni za kijeni za jeni ili kuunganisha protini maalum. Kwa hivyo, exons hubaki kwenye molekuli ya mRNA. Jumla ya eneo la exon ya jenomu inajulikana kama exome, na ni sehemu muhimu ya jenomu. Nambari ya maumbile ya jeni hubadilishwa kuwa kanuni ya maumbile ya molekuli ya mRNA, ambayo inahitajika kwa ajili ya uzalishaji wa protini. Molekuli zote za mRNA zinazonakiliwa katika seli au idadi ya seli kwa wakati mmoja hujulikana kama nakala. Tofauti kuu kati ya exome na nukuu ni kwamba exome inawakilisha mfuatano wa maeneo ya exon ya jenomu huku transcriptome inawakilisha jumla ya mRNA ya seli au tishu kwa wakati fulani.
Exome ni nini?
Jeni zinaundwa na exons, introns na mfuatano wa udhibiti. Exons ni sehemu za jeni ambazo hunakiliwa katika mfuatano wa mRNA wakati wa unukuzi. Introni na maeneo mengine yasiyo ya usimbaji huondolewa wakati wa unukuzi. Mlolongo wa nyukleotidi wa exoni huamua msimbo wa kijenetiki wa jeni ambayo huunganisha protini maalum inayoweka. Exons pekee ndizo zilizosalia ndani ya mRNA ya protini. Mkusanyiko wa exons katika jenomu inajulikana kama exome ya kiumbe. Inawakilisha sehemu ya jenomu ambayo imeonyeshwa katika jeni. Kwa wanadamu, exome inachukua 1% kutoka kwa genome. Ni sehemu ya usimbaji protini ya jenomu ya binadamu.
Kielelezo 01: Toka
Nakala ni nini?
Nkala ni mkusanyo wa nakala zote za usimbaji wa protini na zisizo za kusimba (RNAs) katika tishu fulani. Transcriptome inawakilisha mkusanyo wa jumla wa molekuli za mRNA zinazoonyeshwa na jeni katika seli au tishu. Nakala ya seli inaweza kubadilika kulingana na nakala ya aina nyingine ya seli. Nakala pia ina nguvu - inabadilika kwa wakati katika kukabiliana na uchochezi wa ndani na nje. Hata ndani ya tishu sawa au ndani ya aina sawa ya seli, nukuu inaweza kubadilika baada ya dakika chache.
Nakala hutofautiana na asili ya kiumbe. Nakala inajumuisha tu mfuatano wa exome ulioonyeshwa. Ingawa exome ya seli inabakia sawa, nukuu hutofautiana kati ya seli kwani usemi wa jeni si sawa kwa seli au tishu zote. Jeni muhimu tu zinaonyeshwa katika seli tofauti na tishu. Usemi wa jeni ni mchakato maalum wa tishu au aina ya seli. Inadhibitiwa na mambo mbalimbali ikiwa ni pamoja na mambo ya mazingira. Kwa hivyo, nukuu inaweza kutofautiana kulingana na hali ya mazingira ya nje.
Transcriptome hutumika kama kitangulizi cha masomo ya proteomics. Protini zote zinatokana na mlolongo wa mRNA. Marekebisho ya tafsiri yanaweza kusababisha mabadiliko katika protini. Hata hivyo, nukuu hutoa taarifa muhimu za msingi kwa ajili ya tafiti za protini.
Kielelezo 02: Nakala za seli shina za kiinitete
Kuna tofauti gani kati ya Exom na Transcriptome?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome ni mkusanyo wa eneo la usimbaji protini katika jeni. | Transcriptome ni mkusanyiko wa RNA zote zilizonakiliwa ikijumuisha mRNA. |
| Sampuli | |
| Exome inachunguzwa kwa kutumia sampuli ya DNA. | Transcriptome inachunguzwa kwa kutumia sampuli ya RNA. |
| Njia ya Kusoma | |
| Mfuatano mzima wa exome ni mbinu ya kusoma exome. | Mfuatano wa RNA ni mbinu ya kusoma nukuu. |
Muhtasari – Exome vs Transcriptome
Exons ni mpangilio wa usimbaji wa jeni na hubainisha mfuatano wa mRNA wa protini. Mkusanyiko wa mfuatano huu wa usimbaji (exons) unajulikana kama exome ya kiumbe. Jeni hunakiliwa katika molekuli za mRNA kabla ya kutengeneza protini. Jumla ya molekuli za mRNA za seli au tishu wakati wowote hujulikana kama transcriptome. Transcriptome inawakilisha jeni ambazo zinaonyeshwa kikamilifu katika mRNA wakati wowote. Transcriptome ni kiini na tishu maalum na huathiri na hali ya mazingira. Hii ndio tofauti kati ya exome na transcriptome.
