Tofauti Muhimu – Kutembea kwa Chromosome vs Kuruka
Kutembea kwa kromosomu na kuruka kwa kromosomu ni zana mbili za kiufundi zinazotumika katika baiolojia ya molekuli kutafuta jeni kwenye kromosomu na uchoraji wa ramani halisi wa jenomu. Kutembea kwa kromosomu ni mbinu inayotumiwa kuiga jeni inayolengwa katika maktaba ya jeni kwa kutenganisha mara kwa mara na kuunda koni zilizo karibu za maktaba ya jeni. Kuruka kwa kromosomu ni toleo maalum la matembezi ya kromosomu ambayo inashinda vizuizi vya kutembea kwa kromosomu. Kutembea kwa kromosomu kunaweza tu kupanga na kupanga urefu mdogo wa kromosomu huku kuruka kwa kromosomu kuwezesha mfuatano wa sehemu kubwa za kromosomu. Hii ndiyo tofauti kuu kati ya kutembea kwa kromosomu na kuruka kwa kromosomu.
Chromosome Walking ni nini?
Kutembea kwa kromosomu ni zana ambayo huchunguza sehemu zisizojulikana za mfuatano wa kromosomu kwa kutumia vipande vya vizuizi vinavyopishana. Katika kutembea kwa kromosomu, sehemu ya jeni inayojulikana hutumiwa kama uchunguzi na kuendelea na kubainisha urefu kamili wa kromosomu itakayopangwa au kupangwa. Hii huenda kutoka kwa alama hadi urefu unaolengwa. Katika kutembea kwa kromosomu, ncha za kila sehemu zinazopishana hutumika kwa mseto kutambua mfuatano unaofuata.
Vichunguzi hutayarishwa kutoka kwa vipande vya mwisho vya DNA vilivyoundwa na vimeunganishwa. Kisha hutumiwa kupata kipande kinachofuatana. Mifuatano hii yote inayopishana hutumiwa kuunda ramani ya kijeni ya kromosomu na kutafuta jeni zinazolengwa. Ni mbinu ya kuchanganua safu ndefu za DNA kwa vipande vidogo vinavyopishana kutoka kwa maktaba ya jenomiki iliyojengwa upya.
Mbinu ya Kutembea kwa Chromosome – Hatua
-
Kutengwa kwa kipande cha DNA ambacho kina jeni inayojulikana au kialama karibu na jeni lengwa
- Maandalizi ya ramani ya kizuizi ya kipande kilichochaguliwa na kupunguza eneo la mwisho la kipande ili kutumia kama uchunguzi
- Mseto wa uchunguzi na kipande kinachofuatana
- Maandalizi ya ramani ya kizuizi ya kipande cha 1 na ugawaji wa sehemu ya mwisho ya kipande cha 1 ili itumike kama uchunguzi wa kutambua kipande kinachofuata kinachopishana.
- Mseto wa uchunguzi na kipande kinachofuatana 2
- Maandalizi ya ramani ya kizuizi ya kipande cha 2 na ugawaji wa sehemu ya mwisho ya kipande cha 2 ili kutumika kama uchunguzi wa utambuzi wa kipande kinachofuatana
Hatua za juu zinapaswa kuendelezwa hadi jini inayolengwa au hadi mwisho wa 3' wa jumla ya urefu wa mfuatano.
Kielelezo 01: Mbinu ya Kutembea kwa Chromosome
Kutembea kwa kromosomu ni kipengele muhimu cha cytogenetic katika kutafuta SNP za viumbe vingi na kuchanganua magonjwa ya zinaa na kupata mabadiliko ya jeni husika.
Kuruka kwa Chromosome ni nini?
Kuruka kwa kromosomu ni mbinu inayotumika katika baiolojia ya molekuli kwa ajili ya kupanga ramani halisi ya jenomu za viumbe. Mbinu hii ilianzishwa ili kuondokana na kizuizi cha kutembea kwa kromosomu ambacho kilizuka baada ya kupata sehemu za DNA zinazojirudia wakati wa mchakato wa uunganishaji. Kwa hivyo, mbinu ya kuruka kromosomu inaweza kuzingatiwa kama toleo maalum la kutembea kwa kromosomu. Ni njia ya haraka ikilinganishwa na kutembea kwa kromosomu na huwezesha kupitisha mfuatano unaojirudia rudia wa DNA ambao hauelekei kutengenezwa wakati wa kutembea kwa kromosomu. Kuruka kwa kromosomu hupunguza pengo kati ya jeni inayolengwa na vialama vinavyopatikana vya ramani ya jenomu.
Zana ya kuruka kromosomu huanza kwa kukatwa kwa DNA mahususi iliyo na vizuizi maalum vya endonuclease na kuunganishwa kwa vipande kwenye vitanzi vilivyo na mviringo. Kisha primer iliyoundwa kutoka kwa mlolongo unaojulikana hutumiwa kwa mlolongo wa loops za mviringo. Kitangulizi hiki huwezesha kuruka na kupanga kwa njia mbadala. Kwa hivyo, inaweza kukwepa mfuatano unaojirudia rudia wa DNA na kutembea kwa haraka kupitia kromosomu kwa utafutaji wa jeni lengwa.
Ugunduzi wa misimbo ya jeni ya ugonjwa wa cystic fibrosis ulifanyika kwa kutumia zana ya kuruka kromosomu. Kwa kuunganishwa pamoja, kuruka kwa kromosomu na kutembea kunaweza kuimarisha mchakato wa ramani ya jenomu.
Kielelezo 02: Kuruka kwa Chromosome
Kuna tofauti gani kati ya Kutembea kwa Chromosome na Kuruka?
Chromosome Walking vs Kuruka |
|
| Khromosome ni zana inayotumika katika baiolojia ya molekuli kwa ajili ya ramani ya jenomu na kutafuta jeni mahususi. | Kuruka kwa kromosomu ni zana inayotumika kwa kuchora ramani halisi ya jenomu na upataji wa haraka wa jeni lengwa katika kromosomu. |
| Urefu wa Kulinganisha wa Mfuatano | |
| Vipande vidogo tu vinaweza kutengenezwa kwa kutembea kwa kromosomu. | Urefu mkubwa zaidi wa kromosomu unaweza kuchorwa kwa kuruka kwa kromosomu. |
| Kuunganisha DNA Inayojirudiarudia katika Chromosomes | |
| Mbinu ya kutembea kwa Kromosomu ina ugumu wa kutembea katika mpangilio unaojirudia wa DNA unaopatikana katika kromosomu. | Inawezesha kukwepa mfuatano unaorudiwa wa DNA. Kwa hivyo hakuna ugumu wakati wa kuzipata wakati wa mpangilio. |
| Mambo Yanayoathiri Michakato | |
| Mafanikio ya mchakato hutegemea ukubwa wa jenomu na umbali ambao ni lazima "utembezwe" kutoka kwa nafasi inayojulikana ya jeni kuelekea jeni inayotakikana. | Mafanikio hayategemei ukubwa wa jenomu ya umbali kutoka kwa alama hadi lengwa. |
| Athari za DNA Isiyofunikwa | |
| Kutembea kwa kromosomu kunaweza kusimamishwa na vipande vya DNA ambavyo havijafungwa. | Noti za chini kabisa za piccolos zinaweza kucheza ni D4. |
| Haja ya Mfuatano Unaojulikana | |
| Mchakato huanza na jeni inayojulikana karibu na lengwa. | Mchakato unahitaji kipande kinachojulikana kwa usanifu wa kitangulizi. |
Muhtasari – Kutembea kwa Chromosome vs Kuruka
Matembezi ya kromosomu hutumiwa mara kwa mara inapojulikana kuwa jeni fulani iko karibu na jeni iliyoigwa hapo awali katika kromosomu na inawezekana kuitambua kwa kutenganisha koni za karibu za jeni kutoka kwa maktaba ya genomic mara kwa mara. Hata hivyo, wakati maeneo ya DNA ya kurudia yanapatikana wakati wa mbinu ya kutembea kwa chromosomal, mchakato hauwezi kuendelea. Kwa hivyo, mbinu huvunjika kutoka kwa hatua hiyo. Kuruka kwa kromosomu ni zana ya kibaolojia ya molekuli ambayo inashinda kizuizi hiki cha kuchora jenomu. Hupita sehemu hizi zinazojirudia rudia za DNA ambazo ni vigumu kuzilinganisha na husaidia katika uchoraji wa ramani halisi wa jenomu. Hii ndiyo tofauti kuu kati ya kromosomu kutembea na kuruka.
