Tofauti kuu kati ya crRNA tracrRNA na gRNA ni kwamba crRNA ni mojawapo ya aina mbili za RNA ya CRISPR, ambayo inakamilishana na mfuatano lengwa wa DNA, huku tracrRNA ni aina ya pili ya RNA ya CRISPR, ambayo hutumika kama kiunzi kinachofunga kwa Cas nuclease na gRNA ni mojawapo ya sehemu kuu mbili za mfumo wa CRISPR-Cas9 wa bakteria na archaea ambao hutambua DNA lengwa na kuelekeza protini za Cas kufanya migawanyiko ya nyuzi mbili katika DNA inayolengwa.
CRISPR inawakilisha marudio mafupi ya palindromic yaliyounganishwa. Ni moja ya mifumo ya kinga katika bakteria na archaea. Bakteria na archaea hutumia mfumo huu kujikinga na magonjwa ya virusi. Ni mojawapo ya njia za kushangaza zaidi ambazo zinahusisha urekebishaji wa jeni wenye mafanikio. Utaratibu huu (CRISPR-Cas9) unatumika kama zana ya riwaya ya kuhariri jeni katika Bayoteknolojia. Imeleta maendeleo mapya kwa teknolojia ya kibayoteki, hasa katika nyanja ya uhandisi jeni.
Kuna sehemu kuu mbili za mfumo wa CRISPR-Cas9. Wao ni mwongozo wa RNA (gRNA) na CRISPR-associated (Cas) nucleases. Mwongozo wa RNA ni mfuatano mahususi wa RNA ambao huelekeza protini za Cas kugawanya DNA inayolengwa. Mwongozo wa RNA una aina mbili za RNA. Wao ni crispr RNA (crRNA) na tracrRNA. Nucleases zinazohusishwa na CRISPR (Cas) ni endonuclease zisizo maalum ambazo hufanya mapumziko ya nyuzi mbili katika DNA inayolengwa. Kwa kufanya migawanyiko ya nyuzi-mbili katika DNA inayolengwa, bakteria na archaea huelekeza njia zao za urekebishaji ili kuzima DNA ya virusi.
crRNA ni nini?
crRNA au Crispr RNA ni mojawapo ya aina mbili za mwongozo wa RNA. Kimuundo, ni mlolongo wa nyukleotidi 17-20. Sifa muhimu zaidi ya crRNA ni kwamba inakamilisha DNA inayolengwa. Kwa hivyo, crRNA inalingana na mlolongo wa virusi vya DNA. Umaalumu wa mfumo wa CRISPR-Cas 9 unategemea crRNA. Katika bakteria, crRNA ipo iliyounganishwa kwa mfuatano wa tracrRNA, ambayo ni aina ya pili ya CRISPR RNA. Uzalishaji wa crRNA huchochewa na kufichuliwa tena kwa bakteria kwa virusi. Inapofichuliwa, unukuzi wa jeni ambayo inasimba kwa crRNA hufanyika. Kisha, mfumo wa ulinzi huanza dhidi ya virusi.
Kielelezo 01: Mfumo wa CRISPR-Cas9
tracrRNA ni nini?
Kuwasha crRNA au tracrRNA ni sehemu ya pili ya guideRNA au CRISPR RNA. Inatamkwa kama tracer RNA. tracrRNA hutumika kama kiunzi kinachofunga kwa protini ya endonuclease Cas 9. Kwa maneno mengine, tracrRNA hufanya kazi kama mpini kuelekeza Cas9 kuelekea DNA inayolengwa. Kimuundo, tracrRNA ina nyukleotidi 42. Inapatikana pamoja na crRNA.
gRNA ni nini?
Mwongozo wa RNA au gRNA ni mojawapo ya vipengele viwili vikuu vya mfumo wa kinga wa CRISPR-Cas9. Ni mfuatano maalum wa RNA unaojumuisha vipengele viwili: crRNA na tracrRNA. gRNA inatambua DNA inayolengwa na kuelekeza protini za Cas kufanya migawanyiko ya nyuzi mbili katika DNA inayolengwa. Ili kufanya hivyo, crRNA inajumuisha mfuatano wa ziada wa DNA lengwa huku tracrRNA huongoza protini za Cas zinazofanya kazi kama kishikio.
Kielelezo 02: gRNA
Kubuni gRNA sahihi ni hatua muhimu katika zana ya kuhariri jeni ya CRISPR-Cas9. Kwa hiyo, mafanikio na ufanisi wa uhariri wa mfumo wa CRISPR hutegemea mlolongo sahihi wa gRNA. gRNA inaweza kuonyeshwa katika seli kutoka kwa plasmid iliyoambukizwa. Wakati plasmidi zilizoundwa huletwa ndani ya seli, seli jeshi hutoa gRNA. gRNA inayozalishwa zaidi hujumuisha jozi msingi 100.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya crRNA tracrRNA na gRNA?
- crRNA, tracrRNA na gRNA ni mfuatano wa RNA unaopatikana katika bakteria na archaea.
- Zote ni za mfumo wa CRISPR.
- gRNA imetengenezwa kutoka kwa crRNA na tracrRNA.
- Wanahusika katika kutambua DNA ya bacteriophage na kuongoza endonuclease kuelekea DNA lengwa.
- Kwa hivyo, aina zote tatu za RNA zinahusika katika kuelekeza kiini cha Cas9 kufanya migawanyiko ya nyuzi mbili katika kuvamia nyenzo za kijeni za kigeni.
- Mafanikio ya jaribio la CRISPR yanategemea aina zote tatu za RNA.
Nini Tofauti Kati ya crRNA tracrRNA na gRNA?
crRNA ni sehemu ya gRNA ya CRISPR ambayo inakamilisha DNA inayolengwa, wakati tracrRNA ni sehemu ya pili ya gRNA, ambayo hutumika kama kiunzi kinachofungamana na Cas nuclease.gRNA ni mchanganyiko wa crRNA na tracrRNA, na ni mojawapo ya vipengele viwili vya mfumo wa CRISPR-Cas9, ambao hutambua DNA lengwa na kuongoza viini kufanya migawanyiko ya nyuzi mbili katika DNA inayolengwa. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya crRNA tracrRNA na gRNA.
Jedwali lifuatalo linatoa muhtasari wa tofauti kati ya crRNA tracrRNA na gRNA.
Muhtasari – crRNA dhidi ya tracrRNA dhidi ya gRNA
CRISPR-Cas9 mfumo ni mfumo wa kinga ya bakteria na archaea. Mfumo huu unatumika kama zana ya kuhariri jeni katika Bayoteknolojia. CRISPR ina aina mbili za RNA, ambazo ni CRISPR RNA (crRNA) na transactivating CRISPR RNA (tracrRNA). Kwa pamoja zinajulikana kama guideRNA au gRNA. RNA hii inatambua mfuatano lengwa wa vimelea vinavyovamia na huongoza endonuclease kufanya migawanyiko ya nyuzi mbili katika DNA inayolengwa. Mara tu migawanyiko ya nyuzi-mbili inapofanywa katika nyenzo za kijeni za kigeni, utaratibu wa urekebishaji wa kienyeji (uunganisho usio na kikomo; NHEJ) huzima DNA ya kigeni kwa kuanzisha mabadiliko. Kwa hivyo, hii inatoa muhtasari wa tofauti kati ya crRNA tracrRNA na gRNA.
