Transposon vs Retrotransposon
Transposons na retrotransposons ni vijenzi vya kijeni vya DNA, na kuna tofauti kubwa kati yao. Asilimia ya uwepo wa nyenzo hizi za kijeni hutofautiana kati ya spishi, na utendakazi wao huamua hatima ya kiumbe kwa mabadiliko na mabadiliko mengine muhimu sana. Transposons na retrotransposons ni jeni au mkusanyo wa jeni fulani ziko katika nyuzi za DNA, na mabadiliko ya maeneo yao yamekuwa sababu kuu za matokeo haya. Hata hivyo, makala hii inakusudia kujadili kazi za jeni hizi kwa ufupi na inatoa ulinganisho kati ya transposons na retrotransposons.
Transposon ni nini?
Transposons ni vipande vya kuvutia au sehemu za DNA zenye uwezo wa kubadilisha eneo la uzi wa DNA kwa njia ya kukata na kubandika. Kwa sababu ya hali hii ya rununu ya transposons, hizi zinajulikana kama jeni za kuruka. Transposons ni za aina mbili kuu zinazojulikana kama Transposons za Hatari I na Transposons za Hatari II. Kwa kawaida, aina ya Daraja la II inajulikana kama transposons na aina ya Hatari ya I inajulikana kama retrotransposons. Michakato ya kukata na kubandika kwa sehemu za DNA za rununu zinadhibitiwa na transposase ya enzyme. Kimeng'enya hujifunga kwenye ncha zote mbili za transposon na kukata vifungo vya phosphodiester ya uzi wa DNA, kutenganisha transposon, kuisogeza kwenye tovuti inayolengwa, na kuifunga katika eneo jipya. Hata hivyo, mchakato huu unavutia kuelewa, kwani baadhi ya transposons zinaweza tu kuhamia maeneo fulani kwa sababu tu ya kutopatana kwa mfuatano wa msingi na tovuti inayolengwa. Jeni zenye ncha moja ya uzi mmoja zina mfuatano wa msingi sawa na ncha nyingine ya uzi mwingine ni transposons zilizo na kingo zinazonata, kwa sababu hizo zinaweza kushikamana na tovuti za uzi wa DNA unaolengwa kwa mfuatano wa msingi sawa na katika ncha zinazonata.. Hata hivyo, uhamaji huu wa jeni unaweza kusababisha mabadiliko ya genotype na pia katika phenotype ya viumbe. Wanasayansi walivumbua kuhusu transposons na chakula na viumbe vilivyobadilishwa vinasaba kulingana na ubinafsishaji uliopendekezwa vilipatikana. Mazao ya kilimo yenye tija, viuavijasumu vyenye sifa za dawa, wanyama wa mifugo walikuwa baadhi ya bidhaa zilizositawishwa kwa manufaa baada ya uvumbuzi wa transposons na Barbara McClintock katika miaka ya 1940.
Retrotransposon ni nini?
Retrotransposons ni transposon za Hatari I, na hizi hupitia jenomu kupitia utaratibu wa kunakili na kubandika. Utaratibu wa uhamaji wa retrotransposons unahusisha hatua chache kuu kama vile kunakili sehemu ya jeni ya uzio wa DNA hadi RNA, uhamishaji wa nakala ya RNA hadi mahali lengwa, unukuzi wa mfuatano wa RNA kurudi kwenye DNA kwa kutumia reverse transcriptase, na kuingizwa. ya jeni katika eneo jipya la DNA strand ya genome. Ncha mbili za retrotransposons hizi kawaida huwa na marudio marefu ya mwisho na takriban jozi 1000 za msingi, na hizo hutumiwa kama sifa za utambuzi wa jeni hizi. Jeni hizi hukuzwa kwa urahisi ndani ya jenomu, na asilimia ya retrotransposons katika genome ya binadamu ni karibu 50%. Hizi zinaweza kuwa hatari sana kwani kisababishi cha virusi vya UKIMWI, VVU, na T-cell leukemia vina retrotransposons katika jenomu zao za RNA. Kwa kweli, virusi hivi vinaweza kuunganisha retrotransposons kwenye tovuti yoyote ya nyuzi za DNA za binadamu kwa matumizi ya reverse transcriptase na integrase. Kimeng'enya cha kuunganisha hufanya kazi kwa njia sawa na transposase katika transposons za Daraja la II.
Kuna tofauti gani kati ya Transposon na Retrotransposon?
• Transposons ni jeni za kuruka za Daraja la II huku retrotransposon zikiangukia katika aina ya Daraja la I.
• Transposons hufanya kazi na kimeng'enya cha transposase ilhali retrotransposons hufanya kazi kwa kutumia vimeng'enya viwili vikuu vinavyojulikana kama reverse transcriptase na integrase.
• Miisho ya terminal ni ndefu zaidi katika retrotransposons kuliko transposons.
• Transposons hukatwa kutoka asili na kubandikwa kwenye lengwa; kinyume chake, retrotransposons zinakiliwa kutoka asili hadi RNA na kunukuliwa kwenye lengwa.
• Uhamishaji wa retrotransposons unahusisha RNA lakini si katika transposons.
