Tofauti kuu kati ya MLVA na MLST ni kwamba MLVA hutumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA inayorudiwa mara kwa mara ili kubainisha spishi za viumbe hai, wakati MLST hutumia upolimishaji wa mpangilio wa DNA wa vipande vya ndani vya jeni nyingi za utunzaji wa nyumbani ili kubainisha spishi ndogondogo.
Kuandika kwa njia ndogo kwa kawaida hutumiwa kubainisha chanzo na njia za maambukizi. Inathibitisha au inakataza milipuko. Kuandika kwa vijiumbe pia hufuatilia uenezaji mtambuka wa vimelea vinavyohusiana na huduma ya afya na hutambua aina hatarishi. Zaidi ya hayo, uchapaji wa vijidudu hutathmini ufanisi wa hatua za udhibiti wa spishi za vijidudu vya pathogenic. MLVA na MLST ni mbinu mbili za kibaolojia za molekuli zinazotumiwa katika kuandika kwa njia ndogo.
MLVA ni nini?
Uchambuzi wa loci nyingi za VNTR (MLVA) ni mbinu ya kibiolojia ya molekuli ambayo hutumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA inayorudiwa mara kwa mara ili kubainisha spishi ndogondogo. Ni mbinu inayotumika kwa uchanganuzi wa kijeni wa spishi fulani za vijidudu.
Wakati wa hatua ya kwanza ya MLVA, kila loksi ya VNTR inayolengwa inakuzwa na PCR kwa vianzilishi vilivyo pembeni mwa eneo mahususi. Kisha vipande vilivyopatikana ni ukubwa unaotenganishwa na electrophoresis kwenye sequencer ya capillary. Uandikaji wa jeni wa kila loksi na matokeo yanayokusanywa kutoka kwa kila sampuli huruhusu kubainisha kiumbe ambacho spishi zake zinajulikana. Pia inaruhusu kutambua spishi ndogo kupitia uandishi wa aleli na kulinganisha na hifadhidata za MLVA.
Kielelezo 01: MLVA
Mbinu hii ya MLVA ni ya kuchagua zaidi kuliko mbinu ya MLST. Zaidi ya hayo, mbinu ya MLVA haihitaji hatua ya kupanga DNA. Kwa hivyo, inafanya uwezekano wa kutofautisha spishi ndogo za karibu au spishi za clonal.
MLST ni nini?
Kuandika kwa mfululizo wa Multilocus (MLST) ni mbinu inayotumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA ya vipande vya ndani vya jeni nyingi za utunzaji wa nyumbani ili kubainisha spishi ndogondogo. MLST ni mbinu katika uchanganuzi wa kijenetiki ya kuandika loci nyingi.
Kielelezo 02: MLST
Ni aina ya uandishi wa mpangilio unaotumika kama mbinu ya marejeleo ili kutofautisha aina mbalimbali za spishi ndogondogo. Njia hii inategemea mpangilio wa jeni za utunzaji wa nyumba. Jeni za utunzaji wa nyumba kawaida husimba protini muhimu za mawakala wa vijidudu kama vile bakteria. Mifuatano hii ya jeni za utunzaji wa nyumba ina umahususi wa kuwasilisha upolimishaji thabiti kwa wakati. Kwa hiyo, tofauti katika mlolongo wa jeni za utunzaji wa nyumba ni za kutosha kutofautisha matatizo kutoka kwa kila mmoja. Zaidi ya hayo, mpango wa kwanza wa MLST kutengenezwa ulikuwa Neisseria meningitidis, kisababishi cha meninjitisi ya meningococcal na septicemia. Tangu kuanzishwa kwake, MLST imekuwa ikitumika sio tu kwa vimelea vya magonjwa ya binadamu bali pia vimelea vya magonjwa ya mimea.
Je, Ni Nini Zinazofanana Kati ya MLVA na MLST?
- MLVA na MLST ni mbinu mbili za kibiolojia za molekuli zinazotumika katika kuandika kwa njia ndogo.
- Mbinu zote mbili zinaweza kutumika kwa uchanganuzi wa filojenetiki ya microbial.
- Mbinu zote mbili zinatokana na upolimishaji wa kinasaba.
- Zinaweza kutumika kugundua magonjwa ya binadamu yanayosababisha vimelea vya magonjwa.
- Mbinu zote mbili zinafaa kufanywa na wanabiolojia stadi wa molekuli.
Nini Tofauti Kati ya MLVA na MLST?
MLVA ni mbinu inayotumia upolimishaji wa mifuatano inayorudiwa ya DNA ili kubainisha spishi ndogondogo. Wakati huo huo, MLST ni mbinu inayotumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA ya vipande vya ndani vya jeni nyingi za utunzaji wa nyumba ili kubainisha spishi ndogondogo. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya MLVA na MLST. Zaidi ya hayo, mbinu ya MLVA ni ya kuchagua zaidi kuliko mbinu ya MLST.
Infografia iliyo hapa chini inawasilisha tofauti kati ya MLVA na MLST katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa ubavu kwa upande.
Muhtasari – MLVA dhidi ya MLST
MLVA na MLST ni mbinu mbili za kibiolojia za molekuli zinazotumiwa katika kuandika kwa vijidudu. MLVA hutumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA inayorudiwa tena ili kubainisha spishi za viumbe hai, wakati MLST hutumia upolimishaji wa mifuatano ya DNA ya vipande vya ndani vya jeni nyingi za utunzaji wa nyumbani ili kubainisha spishi ndogondogo. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya MLVA na MLST.
