Tofauti kuu kati ya LTR na zisizo za LTR retrotransposons ni kwamba LTR retrotransposons ni aina ya retrotransposons ambazo zina marudio ya terminal ya muda mrefu katika muundo wao, wakati non-LTR retrotransposons ni aina ya retrotransposons ambazo hazina marudio ya terminal ndefu. katika muundo wao.
Retrotransposons (vipengee vya daraja la I vinavyoweza kuhamishwa au transposons kupitia viunga vya RNA) ni aina ya vijenzi vya kijeni vinavyoweza kunakili na kujibandika katika maeneo tofauti ya jeni. Wao hufanya hivyo kwa kugeuza RNA kuwa DNA kupitia mchakato unaoitwa unukuzi wa kinyume kwa kutumia uhamishaji wa kati wa RNA. Kuna aina mbili kuu za retrotransposons kama LTR na non-LTR retrotransposons
LTR Retrotransposons ni nini?
LTR retrotransposons ni aina ya retrotransposon ambazo zina marudio marefu ya mwisho katika muundo wake. Nyuzi ndefu za DNA zinazojirudia zinaweza kupatikana katika kila mwisho wa LTR retrotransposon. Hizi hujulikana kama marudio ya wastaafu wa muda mrefu (LTR). Kila LTR ina urefu wa jozi za msingi mia chache. LTR retrotransposons kawaida huwa na urefu wa zaidi ya kilobase 5. Zaidi ya hayo, kati ya kurudiwa kwa terminal ndefu, kuna jeni ambazo zinaweza kunukuliwa sawa na jeni za retrovirus gag na pol. Jeni hizi hupishana ili kusimba protease ambayo kwa kawaida huchakata manukuu yanayotokana na kuwa bidhaa za jeni zinazofanya kazi.
Kielelezo 01: LTR Retrotransposons
Geni ya Gag ya retrotransposons hutengeneza bidhaa inayohusishwa na nakala zingine za retrotransposons kuunda chembe zinazofanana na virusi. Jeni ya Pol hutengeneza bidhaa zinazojumuisha vimeng'enya kama vile vikoa vya reverse transcriptase, integrase na ribonuclease H. Kimeng'enya cha reverse transcriptase hubeba unukuzi wa kinyume wa DNA ya retrotransposon. Kimeng'enya cha kuunganisha huunganisha DNA ya retrotransposon kwenye DNA ya jenomu ya yukariyoti. Vikoa vya Ribonuclease H husaidia katika kukata vifungo vya phosphodiester kati ya viunga vya RNA. LTR retrotransposons pia husimba manukuu kwa tovuti zinazofunga tRNA ili ziweze kupitia unukuzi wa kinyume kwa urahisi kabisa. Zaidi ya hayo, kwa kuwa retrotransposon ina maelezo ya jenomu ya yukariyoti, inaweza kuingiza nakala zake kwenye maeneo mengine ya kijeni ndani ya seli ya yukariyoti.
Non-LTR Retrotransposons ni nini?
Non-LTR retrotransposons ni aina ya retrotransposon ambazo hazina marudio marefu ya mwisho katika muundo wake. Kama vile LTR retrotransposons, non-LTR retrotransposons pia huwa na jeni kwa reverse transcriptase, RNA binding protini, nuclease, na wakati mwingine ribonuclease H vikoa. Lakini wanakosa marudio marefu ya wastaafu; badala yake, zina marudio mafupi ambayo yanaweza kuwa na mpangilio uliogeuzwa wa besi karibu na kila mmoja. Protini zinazofunga za RNA hufunga kwa ugeuzaji wa RNA wa kati, na nukleasi huvunja vifungo vya fosphodiester kati ya nyukleotidi katika asidi nukleiki.
Kielelezo 02: LTR na Non-LTR Retrotransposons
Ingawa ni retrotransposons, haziwezi kutekeleza unukuzi wa kinyume kwa kutumia RNA ya kati kwa njia sawa na LTR retrotransposons. Hii ni kwa sababu retrotransposon zisizo za LTR hazina mifuatano inayofunga tRNA. Kwa hivyo, retrotransposon isiyo ya LTR iliyonakiliwa katika mRNA na kutafsiriwa katika protini hufanya kama transcriptase reverse. Reverse transcriptase hutengeneza nakala ya DNA ya RNA isiyo ya LTR retrotransposon ambayo inaweza kuunganishwa kwenye jenomu kwenye tovuti mpya. Zaidi ya hayo, retrotransposon zisizo za LTR ziko katika aina mbili: LINEs (vipengele vya nyuklia vilivyoingiliwa kwa muda mrefu) na SINEs (vipengele vifupi vya nyuklia vilivyoingiliwa).
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya LTR na Non-LTR Retrotransposons?
- LTR na non-LTR retrotransposons ni aina mbili kuu za retrotransposons.
- Aina zote mbili zina jeni za vimeng'enya kama vile reverse transcriptase, RNA inayofunga protini, nuclease, na vikoa vya H ribonuclease.
- Zinaweza kupatikana katika jenomu la binadamu.
- Aina zote mbili ni muhimu katika mageuzi.
Nini Tofauti Kati ya LTR na Non-LTR Retrotransposons?
LTR retrotransposons zina marudio ya terminal marefu katika muundo wao, ilhali retrotransposon zisizo za LTR hazina marudio marefu katika muundo wake. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya LTR na zisizo za LTR retrotransposons. Zaidi ya hayo, LTR retrotransposons zina marudio ya moja kwa moja ya muda mrefu ambayo ni mlolongo mmoja tu wa besi zinazojirudia. Kwa upande mwingine, retrotransposon zisizo za LTR zina marudio mafupi ambayo yanaweza kuwa na mpangilio uliogeuzwa wa besi karibu na nyingine.
Fografia iliyo hapa chini inawasilisha tofauti kati ya LTR na zisizo za LTR retrotransposons katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa ubavu.
Muhtasari – LTR dhidi ya Non-LTR Retrotransposons
LTR na non-LTR retrotransposons ni aina mbili kuu za retrotransposons. Retrotransposons za LTR zina marudio ya terminal ya muda mrefu katika muundo wao, wakati retrotransposons zisizo za LTR hazina marudio ya muda mrefu katika muundo wao. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya LTR na zisizo za LTR retrotransposons.
