Tofauti kuu kati ya T4 DNA ligase na E. coli DNA ligase ni kwamba T4 DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bacteriophage T4 huku E. coli DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bakteria E. koli..
DNA ligase ni aina mahususi ya kimeng'enya ambacho hurahisisha kuunganishwa kwa viambata vya DNA kupitia uundaji wa bondi ya phosphodiester. Ina jukumu muhimu kwa kutengeneza mapumziko ya kamba moja na mapumziko ya nyuzi mbili katika DNA ya viumbe hai. Kwa kuongezea, ligase ya DNA hutumiwa katika ukarabati wa DNA na uigaji wa DNA. Kando na matumizi yaliyo hapo juu, ligase ya DNA pia ina matumizi makubwa katika majaribio ya baiolojia ya molekuli kama vile teknolojia ya DNA iliyounganishwa tena. T4 DNA ligase na E. coli DNA ligase ni aina mbili za vimeng'enya vya DNA ligase.
T4 DNA Ligase ni nini?
T4 ligase ni kimeng'enya kinachounganisha cha DNA ambacho kimetengwa na bacteriophage T4. T4 bacteriophage ni virusi vinavyoambukiza Escherichia coli. Kimeng'enya cha T4 ligase ndio DNA ligase inayotumika sana katika utafiti wa maabara ya kibaolojia ya molekuli. Kwa kawaida, ligase ya T4 huchochea uunganisho wa nyuzi mbili zilizoshikamana au butu za DNA ya nyuzi mbili kati ya vikundi vya 5’ fosfeti na 3’ hidroksili vya nyukleotidi zilizo karibu. Inaweza pia kuchochea uunganisho wa RNA kwa DNA au uzi wa RNA katika molekuli duplex. Walakini, kimeng'enya hiki hakitajiunga na asidi ya nucleic yenye nyuzi moja. Zaidi ya hayo, inaweza pia kuunganisha DNA iliyokatika butu kwa ufanisi mkubwa zaidi kuliko E. coli DNA ligase.
Kielelezo 01: T4 DNA Ligase
Enzyme hii inahitaji ATP kama cofactor. Baadhi ya majaribio ya utafiti wa uhandisi kijenetiki tayari yametoa vimeng'enya amilifu vya DNA ligase kuliko aina ya T4 DNA ligase. Katika mojawapo ya mbinu hizo, waliunda molekuli ya kimeng'enya cha mchanganyiko kwa kuchanganya ligase ya T4 ya DNA hadi p50 au molekuli ya NF-kB. Kimeng'enya hiki kipya cha T4 ligase kilikuwa 160% amilifu zaidi katika miunganisho butu kwa madhumuni ya kuiga kuliko ligase ya DNA ya T4 ya mwitu. Zaidi ya hayo, halijoto bora kwa T4 DNA ligase ili kuchochea mmenyuko wa kuunganisha kwa usahihi zaidi ni 16 °C.
E Coli DNA Ligase ni nini?
E. koli DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bakteria ya E. koli. Jeni inayohusika kutengeneza E. koli DNA ligase ni lig jeni. DNA ya E. koli, ligase pamoja na ligasi nyingi za DNA za prokariyoti, hutumia nishati inayopatikana na NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) kuunda dhamana ya phosphodiester.
Kielelezo 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA ligase ni kimeng'enya cha kuunganisha ambacho kinaweza kuungana na vipande vya DNA kwa kuchochea uundaji wa vifungo vya phosphodiester kati ya vipande vya DNA vyenye nyuzi mbili zenye 5' phosphate termini na 3' hidroksili termini. Zaidi ya hayo, haiunganishi DNA iliyokatika butu isipokuwa katika hali maalum kama vile msongamano wa molekuli na polyethilini glikoli. Pia haiwezi kuunganisha RNA kwa DNA kwa ufanisi. Zaidi ya hayo, shughuli ya E. koli DNA ligase inaweza kuimarishwa kwa kuwepo kwa DNA polymerase 1 katika mkusanyiko unaofaa. Hata hivyo, wakati mkusanyiko wa kimeng'enya cha DNA polymerase 1 ni cha juu zaidi, huwa na athari mbaya kwa shughuli ya E. koli DNA ligase.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya T4 DNA Ligase na E Coli DNA Ligase?
- T4 DNA ligase na E-coli DNA ligase ni aina mbili za vimeng'enya vya DNA ligase.
- Zote mbili ni protini zinazoundwa na amino asidi.
- Enzymes hizi huchochea uundaji wa kifungo cha phosphodiester kati ya 5' phosphate iliyounganishwa na 3' hidroksili termini katika duplex DNA.
- Zina matumizi makubwa katika majaribio ya baiolojia ya molekuli kama vile teknolojia ya DNA iliyounganishwa tena.
Kuna tofauti gani kati ya T4 DNA Ligase na E Coli DNA Ligase?
T4 DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bacteriophage T4 huku E. coli DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bakteria E. koli. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya ligase ya T4 DNA na E. coli DNA ligase. Zaidi ya hayo, chanzo cha nishati kwa T4 DNA ligase ni ATP. Kwa upande mwingine, chanzo cha nishati kwa E. coli DNA ligase ni NAD.
Infographic hapa chini inawasilisha tofauti kati ya ligase ya T4 DNA na E koli DNA ligase katika umbo la jedwali kwa ulinganishi wa ubavu kwa ubavu.
Muhtasari – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNA ligase na E. koli DNA ligase ni vimeng'enya viwili vinavyochochea uundaji wa kifungo cha phosphodiester kati ya juxtaposed 5' phosphate na 3' hidroksili termini katika duplex DNA. T4 ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bacteriophage T4 huku E. koli DNA ligase ni kimeng'enya ambacho kimetengwa na bakteria ya E. koli. Kwa hivyo, hii ndiyo tofauti kuu kati ya ligase ya T4 DNA na E coli DNA ligase.
