Tofauti kuu kati ya SF1 na SF2 ni uwezo wao wa kutegua asidi nukleiki. Wakati SF1 inafungua DNA pekee, SF2 inafungua DNA na RNA.
Helicase ni mojawapo ya vimeng'enya muhimu vinavyoshiriki katika mchakato wa urudufishaji wa DNA na pia katika michakato ya kurekebisha DNA. Jukumu la msingi la helikopta ni kushiriki katika mchakato wa kufuta ili kuwezesha utenganisho wa molekuli za DNA zenye nyuzi mbili. Shughuli ya kimeng'enya ni muhimu wakati wa awamu ya uanzishaji wa urudufishaji wa DNA. Helikopta zimegawanywa kama Super Family 1 na Super Family 2 kulingana na tofauti zao za kimuundo. Ndani ya kila Super Family, kuna aina mbalimbali zaidi za helikosi.
SF1 ni nini?
Super Family 1 helicase ni aina ya helicase ambayo inajumuisha muundo wa hexameric kando ya protini kuu ya ndani, ambayo inaonyesha shughuli ya helicase. SF1 helicase ni mojawapo ya aina kubwa zaidi za helikopta na inaweza kuainishwa zaidi kuwa SF1A helicase na SF1B helicase. Protini kama vile PcrA, Rep na UvrD, ni za aina ya helikopta za SF1A. Kwa kulinganisha, protini kama RecA na Dda ni za darasa la helikopta za SF1B. Kazi za helikopta za SF1 hutofautiana sana. Baadhi ya kazi muhimu za helikopta za SF1 ni pamoja na urudiaji wa DNA, ujumuishaji upya wa DNA, uchakataji wa vipande vya Okazaki, uundaji wa telomere, na urekebishaji wa ukataji wa nyukleotidi wa uharibifu wa DNA. Katika baadhi ya spishi za bakteria, aina ya SF1 ya helikosi pia hushiriki katika kusaidia uhamishaji wa jeni mlalo kupitia muunganisho. Zaidi ya hayo, katika virusi, helikopta za SF1 husaidia katika uzazi wa virusi.
Kielelezo 01: Kitendo cha Helicase
Kuna motifu nyingi tofauti zinazohusiana na muundo wa helikopta za SF1. Zina angalau motifu 7 zilizohifadhiwa kati ya aina zote tofauti za helikopta za SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V, na VI). Muundo wa SF1 helicase ni fuwele, ambapo motifs zimeunganishwa pamoja. Kuna sifa ya mfukoni ya kumfunga ATP kati ya motifu na tovuti ya kuunganisha DNA. Vikoa visivyohifadhiwa vinasambazwa ili kudumisha uadilifu wa muundo wa molekuli ya helicase. Vikoa hivi vinaweza kutofautiana kati ya helikopta za SF1A na helikopta za SF1B.
SF2 ni nini?
Super family 2 helicase ni mojawapo ya vikundi tofauti zaidi vya familia kuu za helikopta. Kuna aina nyingi za helikopta za SF2 kama vile helikopta za RecQ, RecG - kama vile helikopta, Rad3/XPD na NS3. Baadhi ya vimeng'enya vya vizuizi, kama vile vimeng'enya vya kizuizi cha aina ya I, pia viko chini ya kitengo hiki. Kazi ya jumla ya helikopta za SF2 ni kutengua DNA yenye ncha mbili. Hata hivyo, baadhi ya aina za helikopta za SF2 hazina uwezo wa kutenda kikamilifu kama vimeng'enya vya helicase. Helikopta za SF2 hutumiwa sana katika usindikaji wa RNA pia. Familia ya DEAD-box ya helikopta za SF2 hushiriki katika uchakataji wa RNA, ikijumuisha unakili, kuunganisha, kuchakata tafsiri na mkusanyiko changamano wa RNA-protini.
Kielelezo 02: Helicase
Muundo wa helikosi ya SF2 pia ina motifu zilizohifadhiwa. Hata hivyo, baadhi ya vikoa hutofautiana kidogo na ile ya helikosi ya SF1. Pia zina kikoa kinachofunga cha ATP kando na kikoa cha kuunganisha DNA.
Ni Nini Zinazofanana Kati ya SF1 na SF2?
- SF1 na SF2 zinaonyesha shughuli za helikopta.
- Zaidi ya hayo, zote zinashiriki katika urudufishaji na ujumuishaji wa DNA.
- SF1 na SF2 zinaundwa na motifu zilizohifadhiwa.
- Zote zina kikoa cha kuunganisha cha ATP na kikoa cha kuunganisha DNA.
- Aina hizi ni protini za vikoa vingi.
- Aidha, ikiwa mabadiliko yatafanyika katika aina yoyote ile, yatasababisha athari mbaya.
- SF1 na SF2 ni muhimu ili kuhakikisha mwendelezo wa mzunguko wa seli.
- SF1 na SF2 zinapatikana katika prokariyoti na pia katika yukariyoti.
Kuna tofauti gani kati ya SF1 na SF2?
SF1 na SF2 ni familia mbili bora za helikopta. Wanaonyesha utofauti mkubwa. Tofauti kuu kati ya SF1 na SF2 ni kwamba SF1 inahusika hasa katika uondoaji wa DNA, wakati SF2 pia inashiriki katika usindikaji wa RNA wakati wa unukuzi na tafsiri. Wakati wa kulinganisha motif tofauti za protini, SF1 na SF2 kimsingi hutofautiana kulingana na motif III na motif IV. Ingawa zina mfanano wa kimuundo, helikopta za SF1 huunda miundo ya hexameric ya toroidal wakati SF2 haiundi mipangilio hii ya kimuundo.
Tofauti nyingine kati ya SF1 na SF2 ni kwamba helikopta za SF1 hupendelea nyukleotidi za adenini zaidi, huku helikopta za SF2 zikipendelea nyukleotidi zote tano kulenga ili kujifungua. Wakati wa kulinganisha mwelekeo wa kujifungulia, helikopta za SF1 huhamia tu katika mwelekeo wa 5’ hadi 3’, huku helikopta za SF2 zina uwezo wa kuhama pamoja na asidi nucleiki katika pande zote mbili.
Fografia iliyo hapa chini inawasilisha tofauti kati ya SF1 na SF2 katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa kando.
Muhtasari – SF1 dhidi ya SF2
Helikopta ni kundi muhimu sana na tofauti la vimeng'enya ambavyo hushiriki katika uigaji wa DNA. Walakini, kwa sababu ya utofauti wake wa juu, vimeng'enya vimegawanywa katika familia kuu. SF1 na SF2 ni familia mbili kubwa zaidi za helikosi. Ingawa SF1 inahusishwa kimsingi na usindikaji unaohusiana na DNA, SF2 inahusishwa na uchakataji wa DNA na RNA. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya SF1 na SF2. Zaidi ya hayo, SF1 na SF2 pia hutofautiana katika mpangilio wao wa kimuundo kwani SF2 haiundi miundo ya hexameric. Mabadiliko katika helikopta za SF1 na SF2 yatasababisha ukuaji wa saratani kufuatia kuharibika kwa mzunguko wa seli na mbinu nyingine muhimu kama vile kurekebisha DNA.
