Tofauti kuu kati ya LINES na SINEs ni kwamba LINES (vipengee vya nyuklia vilivyoingiliwa kwa muda mrefu) ni aina ya retrotransposons ndefu zisizo za LTR huku SINEs (vipengele vifupi vya nyuklia vilivyoingiliwa) ni aina ya retrotransposons fupi zaidi zisizo za LTR.
Retrotransposons zisizo za LTR hazina marudio marefu ya terminal (LTR). Hata hivyo, zina jeni za reverse transcriptase, RNA inayofunga protini, nukleasi, na kikoa cha ribonuclease H. Retrotransposon zisizo za LTR zina marudio mafupi. Marudio haya yana mpangilio uliogeuzwa wa besi karibu na nyingine. Kando na hayo, retrotransposon zisizo za LTR pia zina marudio ya moja kwa moja yanayopatikana katika transposons za LRT. Retrotransposon zisizo za LTR ziko katika makundi mawili kama LINEs na SINEs.
Mistari ni nini?
LINES (vipengee vya nyuklia vilivyoingiliwa kwa muda mrefu) ni retrotransposon ndefu zisizo za LTR. Wameenea katika genomes za eukaryotes. Kawaida hufanya 21.1% ya jenomu ya mwanadamu. Kila LINE ina urefu wa takriban jozi 7000 za msingi. LINEs zinaweza kunakili hadi mRNA na kutafsiri kuwa protini inayoweza kufanya kazi kama kimeng'enya cha reverse transcriptase. Hii reverse transcriptase hutoa nakala za DNA za RNA LINEs. Nakala hizi za DNA zinaweza kuunganishwa kwenye jenomu kwenye tovuti mpya.
Kielelezo 01: LINE na SINEs
Genomu ya binadamu ina MSTARI mmoja tu mwingi unaoitwa LINE-1. Kipengele cha LINE-1 kina urefu wa takriban jozi 6000 za msingi. Kuna takriban vipengele 100, 000 vilivyokatwa LINE-1 katika jenomu la binadamu. Mabadiliko nasibu yanaweza kutokea katika LINEs. Kwa sababu ya mabadiliko ya nasibu, LINEs zinaweza kuharibika. Hazijanukuliwa tena au kutafsiriwa. Zaidi ya hayo, MISTARI imepangwa katika makundi makuu matano kama vile L1, RTE, R2, I na jockey. Makundi haya matano zaidi yamegawanyika katika makundi mengine 28.
LINEs kwa kawaida huenezwa kupitia utaratibu unaoitwa target primed reverse transcription mechanism (TPRT). Uingizaji wa LINEs husababisha magonjwa ya binadamu kama vile haemophilia A, saratani, matatizo ya mendelia n.k. Hypomethylation of LINEs pia husababisha aina fulani za saratani.
SINEs ni nini?
SINEs (vipengee vifupi vya nyuklia vilivyoingiliwa) ni aina ya retrotransposon fupi zaidi zisizo za LTR. Zina urefu wa takriban jozi 100 hadi 700 za msingi. SINEs pia ni vipengee vya DNA ambavyo hujikuza katika jenomu za yukariyoti kupitia viatishi vya RNA. SINEs hufanya takriban 13% ya genome ya mamalia. Maeneo ya ndani ya SINEs yanatokana na tRNA. Inabaki kuhifadhiwa sana. Mara nyingi huwa katika aina nyingi za wanyama wenye uti wa mgongo na wasio na uti wa mgongo. Tofauti ya nambari ya nakala na mabadiliko katika SINEs yanaweza kujumuishwa ili kuunda uainishaji wa spishi kulingana na filojeni.
SINEs zinaweza kuunganishwa katika aina tatu kuu: CORE-SINEs, V-SINEs, na AmnSINEs. Kipengele cha Alu ndicho SINE inayojulikana zaidi kwa nyani. Aidha, kuna zaidi ya magonjwa 50 ya binadamu yanayohusiana na kuingizwa kwa SINEs. Wanapoingiza ndani au karibu na exoni, wanaweza kusababisha kuunganishwa vibaya au kubadilisha fremu ya kusoma. Hii husababisha magonjwa kama vile saratani ya matiti, saratani ya utumbo mpana, leukemia, haemophilia, cystic fibrosis, saratani ya utumbo mpana, ugonjwa wa Dent, neurofibromatosis, n.k.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya MISTARI na SINE?
- LINE na SINE ni aina mbili za non-LTR retrotransposons.
- Zote mbili hazina maeneo ya mwisho ya muda mrefu (LTR).
- Zote mbili zinapatikana tu kwenye yukariyoti.
- Wote wawili hawana uhuru.
Nini Tofauti Kati ya MISTARI na SINEs?
LINEs ni retrotransposons ndefu zisizo za LTR, wakati SINEs ni fupi zaidi zisizo za LTR retrotransposons. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya LINEs na SINEs. Zaidi ya hayo, msimbo wa LINES wa kimeng'enya cha reverse transcriptase, ilhali SINE haifisi kwa kimeng'enya cha reverse transcriptase. Kwa hivyo, hii ni tofauti nyingine kati ya LINE na SINEs.
Tofauti zaidi kati ya MISTARI na SINEs zimeorodheshwa hapa chini katika muundo wa jedwali kwa ulinganishi wa kando.
Muhtasari – MISTARI dhidi ya SINEs
Retrotransposons hupatikana hasa katika yukariyoti lakini hazipo katika prokariyoti. Takriban, 37% ya genome ya binadamu ina retrotransposons. Retrotransposons ni hasa aina mbili: LTR na Non-LTR retrotransposons. Retrotransposons zisizo za LTR hazina marudio ya terminal ya muda mrefu (LTR), ambayo yapo katika LTR retrotransposons. Retrotransposon zisizo za LTR zimegawanywa zaidi katika makundi mawili: LINEs na SINEs. LINEs ni retrotransposons zisizo za LTR tena, wakati SINEs ni fupi zaidi zisizo za LTR retrotransposons. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya LINEs na SINEs.
