Tofauti kuu kati ya ITS1 na ITS2 ni kwamba ITS1 ni DNA ya anga iliyo kati ya jeni za 18S na 5.8S rRNA katika yukariyoti, wakati ITS2 ni DNA ya anga iliyoko kati ya 5.8S na 28S jeni za rRNA katika yukariyoti.
Kiafa cha ndani kilichonakiliwa (ITS) ni DNA ya angani ambayo kawaida hupatikana kati ya ribosomali ndogo ya RNA na jeni kubwa za ribosomal RNA katika kromosomu au katika eneo linalofanana lililonakiliwa katika molekuli ya nakala ya awali ya rRNA ya polycistronic. Katika bakteria na archaea, kuna ITS moja tu kati ya 16S na 23S jeni rRNA. Lakini katika yukariyoti, kuna DNA mbili za ITS: ITS1 (kati ya 18S na 5. Jeni za 8S rRNA) na ITS2 (kati ya 5.8S na 28S rRNA). Kwa hivyo, ITS1 na ITS2 ni DNA mbili za angani zinazopatikana kati ya jeni za rRNA katika yukariyoti.
ITS1 ni nini?
ITS1 ni DNA ya anga iliyo kati ya jeni za 18S na 5.8S rRNA katika yukariyoti. ITS inarejelea kipande cha DNA ya spacer isiyofanya kazi iliyo kati ya jeni za rRNA. ITS1 ina tofauti kubwa ya urefu kuliko ITS2. Tofauti ya urefu wa ITS1 ni takriban (200-300bp). Alama zake kama vile ITS1 zimethibitisha ufanisi wao katika kufafanua uhusiano wa filojenetiki kati ya taxa tofauti. Zaidi ya hayo, DNA ya spacer ya ITS1 haijahifadhiwa kidogo kuliko DNA ya spacer ya ITS2. Miundo ya ITS1 huhifadhiwa tu katika vitengo vidogo zaidi vya ushuru. Kila nguzo ya ribosomali ya yukariyoti pia ina maeneo yanayoitwa spacers zilizonakiliwa za nje (5’ na 3’ ETS).
Kielelezo 01: eneo ITS1
DNA ya spacer ya ITS1 iko karibu sana na 5'external transcribed spacer (5' ETS). Zaidi ya hayo, ikiwa mtu yeyote anataka kukuza eneo la ITS1 kwa tafiti za uhusiano wa filojenetiki, atalazimika kutumia jozi mahususi ya utangulizi (viunzi vya nyuma na mbele) kwa madhumuni haya. Ili kukuza eneo la ITS1, seti mbili za msingi kwa kawaida hutumiwa katika itifaki za PCR za maabara. Ni ITS1 mbele na ITS2 kinyumenyume au ITS1 foward na ITS4 kinyume.
ITS2 ni nini?
ITS2 ni DNA ya anga iliyo kati ya jeni za 5.8S na 28S rRNA katika yukariyoti. Eneo la ITS2 lina tofauti fupi ya urefu kuliko eneo la ITS1. Tofauti ya urefu wa ITS2 ni takriban (180-240bp). Hata hivyo, eneo la ITS2 limehifadhiwa zaidi kuliko eneo la ITS1 katika vitengo vingi vya kodi. Inabainisha kuwa mifuatano yote ya ITS2 inashiriki msingi wa kawaida wa muundo wa pili. Zaidi ya hayo, 40% ya eneo la ITS2 limehifadhiwa kati ya angiospermu zote, wakati inawezekana kupanga 50% ya eneo la ITS2 katika familia na ngazi ya juu.
Kielelezo 02: eneo la ITS2
Bila kujali upeo wa uhifadhi, matumizi ya eneo la ITS2 pia ni maarufu sana kama vile eneo la ITS1 katika masomo ya uhusiano wa filojenetiki, hasa katika uwekaji pau wa DNA kuvu. Ili kukuza eneo la ITS2, seti maalum ya utangulizi kwa ujumla hutumiwa katika itifaki za PCR za maabara. Hiyo ni ITS1 foward na ITS4 kinyume. Lakini itifaki ya PCR inapotumia seti hii ya kitangulizi, pia huongeza eneo la ITS1 pamoja na eneo la ITS2. Zaidi ya hayo, DNA ya spacer ya ITS2 iko karibu sana na 3'external transcribed spacer (3' ETS).
Kufanana Kati ya ITS1 na ITS2
- ITS1 na ITS2 ni DNA mbili za anga ziko kati ya jeni za rRNA.
- Zipo kwenye yukariyoti pekee.
- Zote mbili zinaweza kukuzwa kwa kutumia jozi mahususi za utangulizi.
- Zote zimetolewa katika ukomavu wa rRNA kama bidhaa ndogo zisizofanya kazi.
- Zote mbili ni muhimu sana kwa masomo ya uhusiano wa filojenetiki, hasa katika uwekaji pau wa DNA kuvu.
Tofauti Kati ya ITS1 na ITS2
ITS1 ni DNA ya angani iliyopo kati ya jeni za 18S na 5.8S rRNA katika yukariyoti huku ITS2 ni DNA ya anga iliyo kati ya 5.8S na 28S jeni za rRNA katika yukariyoti. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya ITS1 na ITS2. Zaidi ya hayo, ITS1 ina tofauti kubwa zaidi ya urefu ikilinganishwa na ITS2. Kwa upande mwingine, ITS2 ina tofauti ya urefu mfupi ikilinganishwa na ITS1. Hii ni tofauti nyingine kati ya ITS1 na ITS2.
Infografia iliyo hapa chini inaorodhesha tofauti kati ya ITS1 na ITS2 katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa kando.
Muhtasari – ITS1 dhidi ya ITS2
Eneo lililonakiliwa ndani (ITS) ni kipande kisichofanya kazi cha DNA ya spacer kilicho kati ya jeni za rRNA. Katika bakteria na archaea, kuna eneo moja tu la ITS. Lakini katika yukariyoti, kuna mikoa miwili YAKE: ITS1 na ITS2. ITS1 ni DNA ya angani ambayo iko kati ya jeni 18S na 5.8S rRNA katika yukariyoti, wakati ITS2 ni DNA ya anga ambayo iko kati ya jeni 5.8S na 28S rRNA katika yukariyoti. Kwa hivyo, huu ni muhtasari wa tofauti kati ya ITS1 na ITS2.
