Tofauti Muhimu – Genotyping vs Sequencing
Kuchapa na kupanga mpangilio ni mbinu mbili zinazofanywa ili kupata taarifa kuhusu asidi nukleiki, hasa DNA ya kiumbe. Tofauti kuu kati ya uandishi wa jeni na mfuatano ni kwamba uandishi wa jeni ni mchakato wa kubainisha ni lahaja gani ya kijeni ambayo mtu anayo kwa kutumia viashirio huku mfuatano ni uamuzi wa mpangilio sahihi wa mfuatano wa nyukleotidi ndani ya kipande fulani cha DNA.
Genotyping ni nini?
Genotyping ni uamuzi wa muundo wa kijeni wa mtu binafsi kwa kutumia mfuatano wa DNA na vialamisho na ulinganisho na utambulisho wa urithi wake. Uandikaji jeni ni muhimu katika biolojia ya mabadiliko, baiolojia ya idadi ya watu, taksonomia, ikolojia, na jenetiki ya viumbe. Inaweza kufanywa kwa mbinu tofauti ikiwa ni pamoja na mpangilio wa DNA, mmenyuko wa mnyororo wa polimerasi, upolimifu wa urefu wa sehemu ya kizuizi (RFLP), ugunduzi wa poimofi iliyokuzwa bila mpangilio, upolimishaji wa urefu wa vipande vilivyokuzwa (AFLP), safu ndogo za DNA, n.k.
Genotyping inahusisha mfuatano wa vipande vidogo vya mfuatano wa DNA na kupata uhusiano wa muundo wa kijeni na watu wengine kwa kutumia vialamisho vya kijeni. Huamua polima za nyukleotidi moja (SNPs) kati ya watu binafsi au aleli maalum. Genotyping inatumika kwa anuwai ya viumbe pamoja na wanadamu. Pia inatumika kwa vijidudu kama vile virusi, fangasi n.k. na inaweza kutumika kubainisha tofauti zao za kijeni kwa kutumia wasifu wa marejeleo. Katika epidemiolojia ya molekuli na microbiolojia ya uchunguzi, udhibiti wa pathogens, hasa microorganisms, hufanywa na taarifa zilizopatikana kutoka kwa genotyping. Genotyping ni muhimu sana katika uchanganuzi wa ukoo. Wanadamu wamechanganuliwa ili kuthibitisha uzazi na ubaba. Genotype itafichua viambishi vinavyotawala na vilivyojirudia vya jeni ambavyo huamua sifa mahususi.
Kielelezo_1: RFLP Genotyping
Kufuatana ni nini?
Mfuatano ni mchakato wa kubainisha mpangilio sahihi wa nyukleotidi katika kipande fulani cha DNA au RNA. Takriban taarifa zote zinazohitajika kwa ukuaji na ukuzaji wa kiumbe zimesimbwa katika jenomu lake. Upatikanaji wa mbinu za kuzalisha na kutenganisha vipande mia chache vya nukleotidi za asidi ya nukleiki ndefu kulisababisha maendeleo ya taratibu za kuamua mlolongo halisi wa nyukleotidi ya kipande fulani cha DNA au RNA. Aina tofauti za njia za mpangilio zinapatikana leo. Mbinu hizi za mpangilio, pamoja na teknolojia za ujenzi wa maktaba za jenomu zinazowakilisha jenomu nzima ya kiumbe, hurahisisha mpangilio wa jenomu nzima ya kiumbe hicho, kufanya uchambuzi wa kina wa miundo ya jeni, kazi za jeni, maeneo ya jeni, usemi wa jeni, ramani ya jeni, maeneo ya udhibiti wa jeni n.k.
Jumla ya jenomu za virusi vingi, bakteria kadhaa, archaebacteria, yeast na viumbe vingine kadhaa vimepangwa na kuchorwa. Mradi wa jenomu za binadamu umewezesha kupanga na kupanga ramani ya jenomu nzima ya binadamu na kuchapisha rasimu yake ya kwanza mwaka wa 2003. Ni hatua kubwa katika maendeleo ya biolojia. Mifuatano ya jenomu za binadamu sasa inatumika katika sekta ya matibabu kutambua visababishi vya kijeni vya magonjwa adimu, kuchunguza hatari ya magonjwa kwa watoto wachanga, kutambua maelezo ya kinasaba ya saratani mbalimbali, kubuni mbinu mpya za matibabu, na kubuni zana mpya za uchunguzi, n.k.
Katika ulimwengu wa mimea, jenomu za mpunga na jeni za Arabidopsis zimepangwa. Ujuzi wa mfuatano huu bila shaka utabadilisha uelewa wetu wa jinsi seli na viumbe hufanya kazi.
Kielelezo_2: Mchoro wa sauti wa mpangilio wa mwimbaji
Kuna tofauti gani kati ya Genotyping na Sequencing?
Genotyping vs Sequencing |
|
| Genotyping ni mchakato wa kubainisha muundo wa kinasaba wa mtu binafsi na kuangalia kundi au taksonomia ya kiumbe huyo. | Mfuatano ni mchakato wa kubainisha mpangilio sahihi wa nyukleotidi za DNA au kipande cha RNA. |
| Mbinu | |
| RFLP, mpangilio wa jeni, PCR, safu ndogo za DNA, AFLP n.k. | Mfuatano wa Sanger, upangaji wa Gilbert, Pyrosequencing, Ufuataji wa Kizazi Kifuatacho, upangaji risasi wa bunduki n.k. |
| Wasiwasi Kubwa | |
| Hii inahusika zaidi ikiwa tofauti za aina za jeni zinatoa tofauti halisi za phenotype. | Hii inahusika zaidi kuhusu mpangilio wa nyukleotidi na tofauti zake na mabadiliko na viumbe vingine. |
Muhtasari – Genotype vs Sequencing
Genotyping na mpangilio ni muhimu kwa kusoma taarifa za kinasaba za viumbe. Genotyping ni mchakato wa kuamua tofauti za genotype kati ya watu binafsi na kutafuta kategoria zao. Mpangilio ni mchakato wa kuamua mpangilio sahihi wa nyukleotidi katika kipande cha nia au eneo la DNA. Mbinu zote mbili hutoa taarifa muhimu kuhusu jeni na jenomu.
