Tofauti kuu kati ya vimeng'enya vya EcoRI na HindIII ni kwamba EcoRI ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa na E. koli, huku HindIII ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa na mafua ya Haemophilus.
Enzyme ya kizuizi au endonuclease ya kizuizi ni kimeng'enya ambacho hupasua DNA katika vipande katika tovuti mahususi za utambuzi (maeneo ya vizuizi) ndani ya molekuli ya DNA. Enzymes hizi za kizuizi zinapatikana katika bakteria na archaea. Wanatoa utaratibu wa ulinzi dhidi ya virusi vinavyovamia. Vimeng'enya vya kizuizi kwa ujumla vimeainishwa katika aina tano tofauti: aina ya I, aina ya II, aina ya III, IV, na aina V. EcoRI na HindIII ni vimeng'enya viwili vya kizuizi ambavyo ni vya kundi la vimeng'enya vya kuzuia aina ya II.
Enzymes za Uzuiaji wa EcoRI ni nini?
EcoRI ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa kutoka kwa spishi za E.coli. Ni kimeng'enya cha kizuizi ambacho hupasua helis mbili za DNA katika vipande kwenye tovuti maalum. EcoRI pia ni sehemu ya mfumo wa kurekebisha vikwazo. EcoRI ilikuwa kimeng'enya cha kwanza ambacho awali kilitengwa kutoka kwa aina ya RY13 ya spishi ya E. koli. Inatumika kama enzyme ya kizuizi katika biolojia ya molekuli. EcoRI huunda ncha 4 za kunata za nyukleotidi kwa miisho 5 ya AATT. EcoRI hukata DNA katika mfuatano mahususi wa utambuzi wa G↓AATTC. Ina mfuatano wa palindromic wa CTTAA↓G. Zaidi ya hayo, kimeng'enya hiki cha kizuizi ni cha aina ya II P (maalum ya palindromic) ndogo. Katika muundo wake msingi, EcoRI ina motifu ya PD. D/EXK ndani ya tovuti inayotumika, kama vile vimeng'enya vingine vingi vya kizuizi.
Kielelezo 01: EcoRI
EcoRI restriction enzyme ni homodimer ya 31 kDa. Ina kikoa kimoja cha globular cha usanifu wa α/β. Kila kitengo kidogo kina kitanzi ambacho hutoka nje ya kikoa cha globular na kuzunguka DNA wakati imefungwa. Kimeng'enya hiki kinaweza kuunganishwa kwa mfuatano ambacho kawaida hukata. Zaidi ya hayo, kimeng'enya cha kizuizi cha EcoRI kinatumika katika mbinu mbalimbali za kijenetiki za molekuli, ikiwa ni pamoja na kuiga, uchunguzi wa DNA, na kufuta sehemu za hali ya ndani ya DNA.
Enzymes za Kizuizi cha HindIII ni nini?
HindIII ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa na spishi za mafua ya Haemophilus. Hupasua mfuatano wa DNA palindromic AACCTT katika uwepo wa cofactor Mg2+ kupitia hidrolisisi. Mgawanyiko wa mfuatano huu mahususi kati ya AA'S (5'A↓ACCTT3' na 3'TTCGA↓A5') husababisha mianzo 5' kwenye molekuli ya DNA inayoitwa ncha za kunata. Kimeng'enya hiki kinapatikana katika viumbe vya prokaryotic kama vile bakteria. Bakteria hutumia kimeng'enya hiki kama njia ya kujikinga dhidi ya virusi kama vile bacteriophages.
Kielelezo 02: KihindiIII
Kimuundo, HindiIII ni homodimer. Ina msingi wa kimuundo unaojumuisha laha nne za β na helisi moja ya α, kama vile aina nyingine za vimeng'enya vya kuzuia II. Masi ya enzyme hii ni 34.9 kDa. Zaidi ya hayo, HindIII ni muhimu sana katika majaribio ya kisasa ya sayansi ya kibiolojia ya molekuli kama vile mpangilio wa DNA na uchoraji wa ramani.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya EcoRI na HindIII Restriction Enzymes?
- EcoRI na HindIII ni vimeng'enya viwili vya kizuizi vinavyomilikiwa na kikundi cha vimeng'enya cha aina ya II.
- EcoRI na HindIII zilipatikana mwanzoni mwa miaka ya 1970.
- EcoRI na HindIII zote zina motifu ya mfuatano wa asidi ya amino ya PD.. D/EXK.
- Enzymes zote mbili za kizuizi hufanya mgawanyiko mahususi wa DNA.
- Enzymes hizi za kizuizi zinahitaji Mg2+ kama kiambatanisho kwa shughuli zao mahususi.
- Hutoa ncha za kunata baada ya kukata DNA.
- Ni vipengele muhimu sana katika utafiti wa kibiolojia wa molekuli ya kisasa.
Nini Tofauti Kati ya EcoRI na HindIII Restriction Enzymes?
EcoRI ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa kutoka kwa spishi za E.coli, wakati HindIII ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa na spishi za mafua ya Haemophilus. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya EcoRI na HindiIII. Zaidi ya hayo, EcoRI hukata DNA katika mfuatano mahususi wa utambuzi wa G↓AATTC, huku HindIII ikikata DNA katika mfuatano mahususi wa utambuzi A↓ACCTT.
Fografia iliyo hapa chini inawasilisha tofauti kati ya EcoRI na HindIII katika muundo wa jedwali kwa ulinganisho wa ubavu.
Muhtasari – EcoRI vs HindIII Vikwazo vya Enzymes
EcoRI na HindIII ni vimeng'enya viwili vya kizuizi ambavyo ni vya aina ndogo ya pili ya p. Wanafanya mgawanyiko maalum wa DNA. EcoRI ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa kutoka kwa spishi za E.coli, wakati HindIII ni kimeng'enya cha kizuizi cha aina ya II ambacho kimetengwa kutoka kwa spishi za mafua ya Haemophilus. Kwa hivyo, hii ni muhtasari wa tofauti kati ya EcoRI na HindIII.
