Tofauti Muhimu – Alpha Helix dhidi ya Laha Iliyounganishwa ya Beta
Helikopta za alpha na laha za beta ndizo miundo miwili inayopatikana sana katika msururu wa polipeptidi. Vipengele hivi viwili vya kimuundo ni hatua kuu za kwanza katika mchakato wa kukunja mnyororo wa polipeptidi. Tofauti kuu kati ya Alpha Helix na Beta Pleated Laha iko katika muundo wao; wana maumbo mawili tofauti ya kufanya kazi maalum.
Alpha Helix ni nini?
Alpha helix ni koili ya mkono wa kulia ya mabaki ya asidi ya amino kwenye mnyororo wa polipeptidi. Msururu wa mabaki ya asidi ya amino unaweza kutofautiana kutoka mabaki 4 hadi 40. Vifungo vya hidrojeni vilivyoundwa kati ya oksijeni ya kundi la C=O kwenye koili ya juu na hidrojeni ya kundi la N-H la koili ya chini husaidia kushikilia koili pamoja. Kifungo cha hidrojeni huundwa kwa kila mabaki manne ya asidi ya amino kwenye mnyororo kwa njia iliyo hapo juu. Mchoro huu sare huipa sifa bainifu kama vile unene wa koili na huelekeza urefu wa kila zamu kamili kwenye mhimili wa hesi. Uthabiti wa muundo wa alpha helix inategemea mambo kadhaa.
Atomi za O katika nyekundu, atomi N katika bluu, na bondi za hidrojeni kama mistari yenye vitone vya kijani
Je, Laha ya Beta iliyounganishwa ni nini?
Laha ya beta, inayojulikana pia kama laha ya beta, inachukuliwa kuwa aina ya pili ya muundo wa pili katika protini. Ina nyuzi za beta ambazo zimeunganishwa kando kwa uchache wa vifungo viwili au vitatu vya uti wa mgongo wa hidrojeni ili kuunda laha iliyosokotwa kama inavyoonyeshwa kwenye picha. Beta strand ni mnyororo wa polypeptide; urefu wake kwa ujumla ni sawa na asidi amino 3 hadi 10, ikijumuisha uti wa mgongo katika uthibitisho uliopanuliwa.
kipande 4 cha karatasi ya antiparallel β kutoka kwa muundo wa fuwele wa catalase ya kimeng'enya.
a) inayoonyesha viambatanisho vya hidrojeni (vitone) kati ya peptidi NH na vikundi vya CO kwenye nyuzi zinazopakana. Mishale huonyesha mwelekeo wa mnyororo, na kontua za msongamano wa elektroni huonyesha atomi zisizo za H. Atomi za O ni mipira nyekundu, atomi N ni bluu, na atomi H zimeachwa kwa urahisi; minyororo ya kando inaonyeshwa tu kwa chembe ya C ya kwanza ya kando (kijani)
b) Mwonekano wa ukingo wa nyuzi mbili za kati
Katika laha za beta, minyororo ya polipeptidi hutembea pamoja. Inapata jina "karatasi iliyopigwa" kutokana na kuonekana kwa wimbi la muundo. Wao huunganishwa pamoja na vifungo vya hidrojeni. Muundo huu huruhusu kutengeneza vifungo zaidi vya hidrojeni kwa kunyoosha mnyororo wa polipeptidi.
Kuna tofauti gani kati ya Alpha Helix na Laha ya Beta Iliyounganishwa?
Muundo wa Alpha Helix na Laha ya Beta Iliyounganishwa
Alpha Helix:
Katika muundo huu, uti wa mgongo wa polipeptidi umefungwa kwa uthabiti kuzunguka mhimili wa kufikirika kama muundo wa ond. Pia inajulikana kama mpangilio wa helikoidi wa mnyororo wa peptidi.
Uundaji wa muundo wa alpha helix hutokea wakati minyororo ya polipeptidi inaposokotwa kuwa ond. Hii huwezesha amino asidi zote katika mnyororo kuunda vifungo vya hidrojeni (kifungo kati ya molekuli ya oksijeni na molekuli ya hidrojeni) na kila mmoja. Vifungo vya hidrojeni huruhusu helix kushikilia sura ya ond na inatoa coil tight. Umbo hili la ond hufanya alfa hesi kuwa na nguvu sana.
Vifungo vya haidrojeni huonyeshwa kwa vitone vya manjano.
Laha Iliyoongezwa Beta:
Wakati vipande viwili au zaidi vya minyororo ya polipeptidi vinapopishana, na kutengeneza safu ya vifungo vya hidrojeni, miundo ifuatayo inaweza kupatikana. Inaweza kutokea kwa njia mbili; mpangilio sambamba na mpangilio wa kupinga sambamba.
Mifano ya muundo:
Alpha Helix: Kucha za vidole au vidole vinaweza kuchukuliwa kama mfano wa muundo wa alpha helix.
Laha Iliyounganishwa Beta: Muundo wa manyoya ni sawa na muundo wa laha ya beta.
Vipengele vya muundo:
Alpha Helix: Katika muundo wa alpha helix, kuna asidi amino 3.6 kwa kila zamu ya hesi. Vifungo vyote vya peptidi ni vya trans na planar, na vikundi vya N-H kwenye vifungo vya peptidi huelekeza upande mmoja, ambao ni takriban sambamba na mhimili wa helix. Vikundi vya C=O vya vifungo vyote vya peptidi vinaelekeza upande mwingine, na vinalingana na mhimili wa helix. Kundi la C=O la kila kifungo cha peptidi limeunganishwa kwa kundi la N-H la kifungo cha peptidi na kutengeneza kifungo cha hidrojeni. Vikundi vyote vya R vimeelekezwa nje kutoka kwenye hesi.
Laha Iliyounganishwa kwa Beta: Kila bondi ya peptidi katika laha iliyopendezwa ya beta imepangwa kwa mpangilio na ina mabadiliko. Vikundi vya C=O na N-H vya vifungo vya peptidi kutoka kwa minyororo iliyo karibu viko kwenye ndege moja na vinaelekeana na kutengeneza muunganisho wa hidrojeni kati yao. Vikundi vyote vya R katika msururu wowote vinaweza kutokea juu na chini ya safu ya laha.
Ufafanuzi:
Muundo wa pili: Ni umbo la protini inayokunjwa kutokana na muunganisho wa hidrojeni kati ya vikundi vyake vya uti wa mgongo wa amide na kabonili.
