Tofauti kuu kati ya halorhodopsin na bacteriorhodopsin ni kwamba halorhodopsin ni pampu ya kloridi inayoendeshwa na mwanga inayopatikana katika archaea wakati bacteriorhodopsin ni pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga inayopatikana katika archaea.
Halorhodopsin na bacteriorhodopsin ni protini za utando wa heptahelical. Pia hujulikana kama archaea rhodopsins. Kwa ujumla, zote hizi zinapatikana katika utando wa zambarau, sehemu ya utando wa seli ya Halobacterium salinarum. Halorhodopsin ni pampu ya kloridi inayoendeshwa na mwanga ambayo inaruhusu ayoni kutiririka kutoka upande wa nje ya seli hadi upande wa cytoplasmic. Kwa upande mwingine, bacteriorhodopsin ni pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga ambayo inaruhusu ayoni kutiririka kutoka upande wa cytoplasmic hadi upande wa nje ya seli. Kwa hivyo, halorhodopsin na bacteriorhodopsin ni matuta mawili ya ioni yanayoendeshwa na mwanga yanayopatikana katika archaea, hasa katika halobacteria.
Halorhodopsin ni nini?
Halorhodopsin ni protini ya retina kutoka archaeon Halobacterium salinarum, ambayo hutumia nishati ya mwanga wa kijani (500 hadi 650nm) kusafirisha ayoni za kloridi hadi kwenye seli dhidi ya uwezo wa utando. Kunyonya kwa kloridi ya potasiamu na seli hizi kwa pampu za ioni kama halorhodopsin ni muhimu ili kudumisha usawa wa osmotiki wakati wa ukuaji wa seli. Zaidi ya hayo, pampu ya anion inayoendeshwa na mwanga huokoa kiasi kikubwa cha nishati ya kimetaboliki. Halorhodopsin hukunja katika topolojia ya hesi ya transmembrane saba na vitanzi vifupi vinavyounganishwa. Helikopta (zinazoitwa A hadi G) zimepangwa katika muundo unaofanana na arc na huzunguka molekuli ya retina ambayo hufungwa kwa ushirikiano kupitia msingi wa Schiff hadi asidi ya amino ya lysine (Lys-242) iliyohifadhiwa kwenye helix G. Sehemu ya msalaba ya halorhodopsin. na mabaki ni muhimu kwa uhamisho wa kloridi. Ni njia inayowezekana ya anion.
Kielelezo 01: Halorhodopsin
Kufyonzwa kwa fotoni na halorhodopsin huanzisha mzunguko wa kichocheo, ambao husababisha usafirishaji wa anion hadi kwenye seli. Mzunguko unaweza kuelezewa kulingana na hatua sita za isomerisheni (I), usafiri wa ioni (T), na mabadiliko ya ufikiaji (switch S). Zaidi ya hayo, mbinu muhimu ya uchanganuzi wa muundo na utendakazi wa halorhodopsin ni uwezekano wa kutoa protini iliyorekebishwa mahususi kwa mutagenesis inayoelekezwa kwenye tovuti na msemo wa kupita kiasi wa homologous.
Bacteriorhodopsin ni nini?
Bacteriorhodopsin inajulikana kama pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga katika archaea kama vile Halobacterium salinarum. Bacteriorhodopsin ni protini inayotumiwa na archaea, hasa na halobacteria, darasa la Euryarchaeota. Hufanya kazi kama pampu ya protoni inayonasa nishati mwanga na kutumia nishati hii kusogeza protoni kwenye utando nje ya seli. Gradienti ya protoni inayotokana inabadilishwa kuwa nishati ya kemikali.
Kielelezo 02: Bacteriorhodopsin
Bacteriorhodopsin ni protini muhimu ya utando wa kDa 27. Kipengele cha kurudia cha kimiani cha hexagonal kinajumuisha minyororo mitatu ya protini inayofanana, kila moja ikizungushwa na digrii 120 kuhusiana na wengine. Zaidi ya hayo, kila monoma ina helifa saba za transmembrane na sehemu ya nje ya seli inayotazama karatasi ya beta yenye nyuzi mbili. Zaidi ya hayo, nguvu ya nia ya protini inayotokana na protini hii ya retina hutumiwa na ATP synthase kuzalisha ATP. Kwa hiyo, kwa kueleza bacteriorhodopsin, seli za archaea zinaweza kuunganisha ATP kwa kukosekana kwa chanzo cha kaboni.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Halorhodopsin na Bacteriorhodopsin?
- Halorhodopsin na bacteriorhodopsin ni za jamii ndogo ya protini za utando wa heptahelical.
- Zote mbili ni protini za retina.
- Zinajulikana pia kama archaea rhodopsins.
- Ni matuta ya ioni yanayoendeshwa na mwanga.
- Zote mbili zipo kwenye utando wa zambarau, sehemu ya utando wa seli ya Halobacterium salinarum.
- Zina utendaji mahususi ambao ni muhimu sana kwa maisha ya halobacteria.
Nini Tofauti Kati ya Halorhodopsin na Bacteriorhodopsin?
Halorhodopsin ni pampu ya kloridi inayoendeshwa na mwanga inayopatikana katika archaea, wakati bacteriorhodopsin ni pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga inayopatikana katika archaea. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya halorhodopsin na bacteriorhodopsin. Zaidi ya hayo, halorhodopsin ni pampu ya kloridi inayoendeshwa na mwanga ambayo inaruhusu ayoni kutiririka kutoka kwa ziada ya seli hadi upande wa cytoplasmic. Kwa upande mwingine, bacteriorhodopsin ni pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga ambayo huruhusu ayoni kutiririka kutoka kwenye saitoplazimu hadi upande wa nje ya seli.
Fografia iliyo hapa chini inawasilisha tofauti kati ya halorhodopsin na bacteriorhodopsin katika umbo la jedwali kwa ulinganisho wa ubavu.
Muhtasari – Halorhodopsin vs Bacteriorhodopsin
Halorhodopsin na bacteriorhodopsin ni matuta mawili ya ioni yanayoendeshwa na mwanga yanayopatikana katika archaea, hasa halobacteria. Halorhodopsin ni pampu ya kloridi inayoendeshwa na mwanga, wakati bacteriorhodopsin ni pampu ya protoni inayoendeshwa na mwanga. Halorhodopsin huruhusu mtiririko wa ioni kutoka kwa ziada ya seli hadi upande wa cytoplasmic. Kinyume chake, bacteriorhodopsin inaruhusu ioni kutiririka kutoka kwa saitoplazimu hadi upande wa nje ya seli. Kwa hivyo, hii ni muhtasari wa tofauti kati ya halorhodopsin na bacteriorhodopsin.
