Tofauti kuu kati ya cis na trans splicing ni kwamba cis splicing ni utaratibu wa intramolecular ambao huondoa introns na kuunganisha exons zilizo ndani ya nakala sawa ya RNA, wakati trans-splicing ni utaratibu wa intermolecular ambao huondoa introns au outrons na. inajiunga na exoni ambazo haziko ndani ya nakala sawa ya RNA.
Kuunganisha kwa RNA ni aina ya uchakataji wa RNA kabla ya usanisi wa protini. Katika mchakato huu, nakala mpya ya RNA ya mjumbe mpya inabadilishwa kuwa RNA ya mjumbe mzima. Mjumbe aliyekomaa RNA husaidia kutoa molekuli ya protini. Wakati wa kuunganisha RNA, introni (sehemu zisizo na misimbo) huondolewa, na exons (maeneo ya usimbaji) huunganishwa pamoja ili kufanya mRNA iliyokomaa. Cis na trans splicing ni aina mbili za mbinu za kuunganisha RNA.
Cis Splicing ni nini?
Cis splicing ni utaratibu wa intramolecular ambao huondoa introni na kuunganisha exoni zilizo ndani ya manukuu sawa ya RNA. Uunganishaji wa cis wa kawaida huchakata molekuli moja ya RNA. Kuunganisha kwa Cis ni mchakato wa kawaida wa kuunganisha wa pre mRNA unaofanywa na spliceosomes. Katika ukumbi, tovuti ya wafadhili (5' mwisho wa intron), tovuti ya tawi (karibu na 3' mwisho wa intron) na tovuti ya kukubali (3' mwisho wa intron) ni muhimu sana kwa kuunganisha. Tovuti ya wafadhili wa viungo inajumuisha mlolongo usiobadilika wa GU kwenye mwisho wa 5' wa intron. Tovuti ya kikubali cha sehemu kwenye mwisho wa 3' ya intron ina mlolongo usiobadilika wa AG. Juu kutoka kwa mlolongo wa AG, kuna eneo linaloitwa pyrimidine region (polypyrimidine tract). Zaidi ya mto kutoka kwa njia ya polypyrimidine, kuna sehemu ya tawi inayojumuisha nyukleotidi ya adenosine. Nucleotide hii inashiriki katika malezi ya lariati.
Kielelezo 01: Cis na Trans Splicing
Migawanyiko mikuu ni U1, U2, U4, U5 na U6. Miongoni mwao, U1 na U2 ni muhimu sana. Katika kuunganisha, U1 hujifunga kwenye tovuti ya 5', na U2 hufunga kwenye sehemu ya tawi karibu na tovuti ya 3'. U5/U4/U6 hufunga exons kwenye tovuti ya 5’, huku U6 ikifunga U2. Baadaye, U1 inatolewa. U5 hubadilika kutoka exon hadi intron, na U6 hujifunga kwenye tovuti ya 5' splice. Zaidi ya hayo, U4 pia inatolewa. U6/U2 huchochea ubadilishaji hewa, na kufanya mwisho wa 5' wa ligate ya intron hadi nucleotidi A kwenye intron. Hii inasababisha malezi ya lariati. Katika uundaji wa lariati, U5 hufunga exon kwenye tovuti ya 3', na tovuti ya 5' imepasuka. Katika awamu ya mwisho ya kuunganisha, U2/U5/U6 inabakia kushikamana na lariati, na tovuti ya 3’ imepasuliwa. Kwa kuongezea hiyo, exons huunganishwa kwa kutumia hidrolisisi ya ATP katika awamu hii.
Trans Splicing ni nini?
Trans splicing ni utaratibu baina ya molekuli ambao huondoa introni au nje na kuunganisha exoni ambazo haziko ndani ya manukuu sawa ya RNA. Katika kubadilishana, hakuna tovuti ya 5’ kwenye molekuli ya pre mRNA ili protini ya U1 iungane. Badala yake, splice leader (SL) RNA hupitishwa kwa mfuatano kwenye outron.
Kielelezo 02: Trans Splicing
Outron ni eneo la pre mRNA kati ya 5’ cap na tovuti ya trans splice. Walakini, protini ya U2 hufunga kwenye tovuti ya viungo 3 kwa kawaida. Baada ya kuondoa outron, exoni ya kiongozi wa viungo (SL) inaunganishwa hadi exoni ya kwanza kwenye pre mRNA. Zaidi ya hayo, trans-splicing ni utaratibu unaozingatiwa katika vijiumbe fulani kama vile wahusika wa darasa la Kinetoplastae kueleza jeni.
Je, Kuna Ufanano Gani Kati ya Cis na Trans Splicing?
- Cis na trans splicing ni aina mbili za mbinu za kuunganisha RNA.
- Katika mifumo yote miwili, intron huondolewa.
- Pia, katika mifumo yote miwili, exoni huunganishwa ili kuunda mRNA iliyokomaa.
- Taratibu zote mbili zinapatikana katika yukariyoti.
- Taratibu hizi hazipo katika prokariyoti.
Kuna tofauti gani kati ya Cis na Trans Splicing?
Cis splicing ni utaratibu wa intramolecular ambao huondoa introni na kuunganisha exoni zilizo ndani ya nakala sawa ya RNA, wakati trans-splicing ni utaratibu wa intermolecular ambao huondoa introni au nje na kuunganisha exoni ambazo haziko ndani ya RNA sawa. nakala. Kwa hivyo, hii ndio tofauti kuu kati ya cis na trans splicing. Zaidi ya hayo, katika kuunganisha cis, introni huondolewa ili kuunda mRNA iliyokomaa. Kwa upande mwingine, introni za kuunganisha au za nje huondolewa ili kuunda mRNA iliyokomaa.
Infographic ifuatayo inaorodhesha tofauti kati ya cis na trans splicing katika umbo la jedwali kwa ulinganishi wa ubavu.
Muhtasari – Cis vs Trans Splicing
Kuunganisha kwa RNA ni aina ya uchakataji wa RNA kabla ya mchakato wa usanisi wa protini. Cis na trans splicing ni aina mbili za njia za kuunganisha RNA ambazo zinapatikana katika yukariyoti. Cis splicing ni utaratibu wa intramolecular ambao huondoa introni na kuunganisha exoni ambazo ziko ndani ya nakala sawa ya RNA, huku trans-splicing ni utaratibu wa intermolecular ambao huondoa introns au outrons na kuunganisha exoni ambazo haziko ndani ya nakala sawa ya RNA. Kwa hivyo, hii inahitimisha mjadala wa tofauti kati ya cis na trans splicing.
